Protein–RNA interactions for Protein: P22339

Gadd45b, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 beta, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gadd45bP22339 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gadd45bP22339 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gadd45bP22339 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gadd45bP22339 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gadd45bP22339 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gadd45bP22339 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gadd45bP22339 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gadd45bP22339 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gadd45bP22339 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gadd45bP22339 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gadd45bP22339 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Gadd45bP22339 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gadd45bP22339 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gadd45bP22339 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gadd45bP22339 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Gadd45bP22339 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gadd45bP22339 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gadd45bP22339 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gadd45bP22339 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gadd45bP22339 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gadd45bP22339 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gadd45bP22339 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gadd45bP22339 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gadd45bP22339 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gadd45bP22339 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gadd45bP22339 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gadd45bP22339 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gadd45bP22339 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gadd45bP22339 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gadd45bP22339 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gadd45bP22339 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gadd45bP22339 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gadd45bP22339 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gadd45bP22339 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gadd45bP22339 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gadd45bP22339 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gadd45bP22339 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gadd45bP22339 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gadd45bP22339 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gadd45bP22339 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gadd45bP22339 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gadd45bP22339 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gadd45bP22339 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Gadd45bP22339 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gadd45bP22339 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gadd45bP22339 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gadd45bP22339 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gadd45bP22339 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gadd45bP22339 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gadd45bP22339 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gadd45bP22339 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gadd45bP22339 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gadd45bP22339 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gadd45bP22339 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gadd45bP22339 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gadd45bP22339 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gadd45bP22339 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gadd45bP22339 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gadd45bP22339 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Gadd45bP22339 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gadd45bP22339 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Gadd45bP22339 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gadd45bP22339 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gadd45bP22339 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gadd45bP22339 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gadd45bP22339 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gadd45bP22339 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gadd45bP22339 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gadd45bP22339 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gadd45bP22339 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gadd45bP22339 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gadd45bP22339 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gadd45bP22339 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gadd45bP22339 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gadd45bP22339 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gadd45bP22339 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gadd45bP22339 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gadd45bP22339 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gadd45bP22339 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gadd45bP22339 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gadd45bP22339 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gadd45bP22339 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gadd45bP22339 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Gadd45bP22339 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gadd45bP22339 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gadd45bP22339 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gadd45bP22339 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gadd45bP22339 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gadd45bP22339 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gadd45bP22339 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gadd45bP22339 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Gadd45bP22339 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gadd45bP22339 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gadd45bP22339 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gadd45bP22339 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gadd45bP22339 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gadd45bP22339 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gadd45bP22339 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gadd45bP22339 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gadd45bP22339 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.1 ms