Protein–RNA interactions for Protein: P19253

Rpl13a, 60S ribosomal protein L13a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13aP19253 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl13aP19253 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl13aP19253 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl13aP19253 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl13aP19253 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl13aP19253 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl13aP19253 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl13aP19253 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl13aP19253 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl13aP19253 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl13aP19253 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl13aP19253 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl13aP19253 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl13aP19253 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl13aP19253 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl13aP19253 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl13aP19253 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl13aP19253 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl13aP19253 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl13aP19253 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl13aP19253 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl13aP19253 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl13aP19253 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl13aP19253 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl13aP19253 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl13aP19253 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl13aP19253 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl13aP19253 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl13aP19253 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl13aP19253 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl13aP19253 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl13aP19253 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl13aP19253 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl13aP19253 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl13aP19253 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl13aP19253 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl13aP19253 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl13aP19253 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl13aP19253 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl13aP19253 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl13aP19253 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl13aP19253 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl13aP19253 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl13aP19253 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl13aP19253 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl13aP19253 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl13aP19253 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl13aP19253 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl13aP19253 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl13aP19253 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl13aP19253 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl13aP19253 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl13aP19253 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rpl13aP19253 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl13aP19253 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl13aP19253 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl13aP19253 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl13aP19253 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl13aP19253 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl13aP19253 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl13aP19253 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl13aP19253 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl13aP19253 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl13aP19253 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl13aP19253 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl13aP19253 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl13aP19253 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl13aP19253 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl13aP19253 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl13aP19253 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl13aP19253 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl13aP19253 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl13aP19253 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl13aP19253 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl13aP19253 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl13aP19253 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl13aP19253 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl13aP19253 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl13aP19253 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl13aP19253 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl13aP19253 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl13aP19253 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl13aP19253 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl13aP19253 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl13aP19253 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl13aP19253 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl13aP19253 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl13aP19253 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl13aP19253 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl13aP19253 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl13aP19253 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl13aP19253 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl13aP19253 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl13aP19253 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl13aP19253 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl13aP19253 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl13aP19253 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl13aP19253 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl13aP19253 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl13aP19253 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms