Protein–RNA interactions for Protein: P19228

Csn1s1, Alpha-S1-casein, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn1s1P19228 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Csn1s1P19228 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Csn1s1P19228 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Csn1s1P19228 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Csn1s1P19228 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Csn1s1P19228 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Csn1s1P19228 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Csn1s1P19228 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Csn1s1P19228 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Csn1s1P19228 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Csn1s1P19228 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Csn1s1P19228 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Csn1s1P19228 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Csn1s1P19228 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Csn1s1P19228 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Csn1s1P19228 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Csn1s1P19228 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Csn1s1P19228 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Csn1s1P19228 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Csn1s1P19228 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Csn1s1P19228 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Csn1s1P19228 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Csn1s1P19228 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Csn1s1P19228 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Csn1s1P19228 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Csn1s1P19228 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Csn1s1P19228 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Csn1s1P19228 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Csn1s1P19228 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Csn1s1P19228 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Csn1s1P19228 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Csn1s1P19228 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Csn1s1P19228 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Csn1s1P19228 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Csn1s1P19228 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Csn1s1P19228 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Csn1s1P19228 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Csn1s1P19228 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Csn1s1P19228 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Csn1s1P19228 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Csn1s1P19228 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Csn1s1P19228 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Csn1s1P19228 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Csn1s1P19228 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Csn1s1P19228 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Csn1s1P19228 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Csn1s1P19228 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Csn1s1P19228 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Csn1s1P19228 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Csn1s1P19228 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Csn1s1P19228 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Csn1s1P19228 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Csn1s1P19228 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Csn1s1P19228 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Csn1s1P19228 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Csn1s1P19228 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Csn1s1P19228 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Csn1s1P19228 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Csn1s1P19228 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Csn1s1P19228 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Csn1s1P19228 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Csn1s1P19228 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Csn1s1P19228 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Csn1s1P19228 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Csn1s1P19228 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Csn1s1P19228 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Csn1s1P19228 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Csn1s1P19228 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Csn1s1P19228 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Csn1s1P19228 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Csn1s1P19228 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Csn1s1P19228 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Csn1s1P19228 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Csn1s1P19228 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Csn1s1P19228 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Csn1s1P19228 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Csn1s1P19228 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Csn1s1P19228 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Csn1s1P19228 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Csn1s1P19228 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Csn1s1P19228 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Csn1s1P19228 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Csn1s1P19228 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Csn1s1P19228 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Csn1s1P19228 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Csn1s1P19228 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Csn1s1P19228 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Csn1s1P19228 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Csn1s1P19228 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Csn1s1P19228 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Csn1s1P19228 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Csn1s1P19228 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Csn1s1P19228 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Csn1s1P19228 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Csn1s1P19228 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Csn1s1P19228 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Csn1s1P19228 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Csn1s1P19228 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Csn1s1P19228 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Csn1s1P19228 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms