Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
P18530 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P18530 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
P18530 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P18530 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P18530 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P18530 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
P18530 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P18530 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P18530 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P18530 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P18530 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P18530 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P18530 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
P18530 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P18530 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
P18530 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P18530 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P18530 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P18530 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
P18530 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P18530 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P18530 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
P18530 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P18530 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
P18530 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P18530 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
P18530 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P18530 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P18530 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P18530 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P18530 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
P18530 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
P18530 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P18530 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P18530 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
P18530 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
P18530 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P18530 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P18530 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P18530 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
P18530 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P18530 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
P18530 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P18530 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P18530 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P18530 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
P18530 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P18530 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P18530 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P18530 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
P18530 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
P18530 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P18530 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P18530 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P18530 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
P18530 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P18530 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P18530 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
P18530 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P18530 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P18530 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
P18530 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P18530 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
P18530 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
P18530 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P18530 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
P18530 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
P18530 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
P18530 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P18530 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
P18530 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
P18530 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P18530 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
P18530 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
P18530 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P18530 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P18530 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P18530 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P18530 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P18530 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P18530 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P18530 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P18530 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P18530 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P18530 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P18530 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P18530 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
P18530 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
P18530 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
P18530 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
P18530 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
P18530 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
P18530 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P18530 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P18530 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P18530 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P18530 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
P18530 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
P18530 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms