Protein–RNA interactions for Protein: P14206

Rpsa, 40S ribosomal protein SA, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpsaP14206 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RpsaP14206 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RpsaP14206 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RpsaP14206 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RpsaP14206 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RpsaP14206 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RpsaP14206 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RpsaP14206 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RpsaP14206 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RpsaP14206 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RpsaP14206 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RpsaP14206 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RpsaP14206 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RpsaP14206 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RpsaP14206 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RpsaP14206 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RpsaP14206 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RpsaP14206 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RpsaP14206 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RpsaP14206 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RpsaP14206 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RpsaP14206 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RpsaP14206 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RpsaP14206 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RpsaP14206 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RpsaP14206 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RpsaP14206 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RpsaP14206 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RpsaP14206 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RpsaP14206 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RpsaP14206 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RpsaP14206 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RpsaP14206 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RpsaP14206 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RpsaP14206 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RpsaP14206 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RpsaP14206 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RpsaP14206 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RpsaP14206 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RpsaP14206 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RpsaP14206 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RpsaP14206 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RpsaP14206 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RpsaP14206 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RpsaP14206 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RpsaP14206 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RpsaP14206 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RpsaP14206 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RpsaP14206 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RpsaP14206 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RpsaP14206 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RpsaP14206 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RpsaP14206 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RpsaP14206 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RpsaP14206 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
RpsaP14206 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RpsaP14206 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RpsaP14206 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
RpsaP14206 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
RpsaP14206 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RpsaP14206 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RpsaP14206 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RpsaP14206 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RpsaP14206 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RpsaP14206 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RpsaP14206 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RpsaP14206 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RpsaP14206 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RpsaP14206 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RpsaP14206 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RpsaP14206 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RpsaP14206 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RpsaP14206 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RpsaP14206 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RpsaP14206 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RpsaP14206 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RpsaP14206 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RpsaP14206 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RpsaP14206 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RpsaP14206 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RpsaP14206 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RpsaP14206 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RpsaP14206 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RpsaP14206 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RpsaP14206 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RpsaP14206 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RpsaP14206 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RpsaP14206 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RpsaP14206 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RpsaP14206 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RpsaP14206 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RpsaP14206 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RpsaP14206 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RpsaP14206 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RpsaP14206 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RpsaP14206 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RpsaP14206 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RpsaP14206 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RpsaP14206 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RpsaP14206 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms