Protein–RNA interactions for Protein: P0CW03

Ly6c2, Lymphocyte antigen 6C2, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6c2P0CW03 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ly6c2P0CW03 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ly6c2P0CW03 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ly6c2P0CW03 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ly6c2P0CW03 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ly6c2P0CW03 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ly6c2P0CW03 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ly6c2P0CW03 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ly6c2P0CW03 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ly6c2P0CW03 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ly6c2P0CW03 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ly6c2P0CW03 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ly6c2P0CW03 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Ly6c2P0CW03 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ly6c2P0CW03 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ly6c2P0CW03 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ly6c2P0CW03 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ly6c2P0CW03 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ly6c2P0CW03 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ly6c2P0CW03 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ly6c2P0CW03 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ly6c2P0CW03 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ly6c2P0CW03 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ly6c2P0CW03 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ly6c2P0CW03 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ly6c2P0CW03 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ly6c2P0CW03 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ly6c2P0CW03 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ly6c2P0CW03 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ly6c2P0CW03 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ly6c2P0CW03 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ly6c2P0CW03 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ly6c2P0CW03 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ly6c2P0CW03 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ly6c2P0CW03 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ly6c2P0CW03 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ly6c2P0CW03 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ly6c2P0CW03 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ly6c2P0CW03 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ly6c2P0CW03 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ly6c2P0CW03 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ly6c2P0CW03 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ly6c2P0CW03 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ly6c2P0CW03 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ly6c2P0CW03 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ly6c2P0CW03 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ly6c2P0CW03 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ly6c2P0CW03 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ly6c2P0CW03 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ly6c2P0CW03 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ly6c2P0CW03 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ly6c2P0CW03 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ly6c2P0CW03 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ly6c2P0CW03 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ly6c2P0CW03 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ly6c2P0CW03 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ly6c2P0CW03 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ly6c2P0CW03 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ly6c2P0CW03 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ly6c2P0CW03 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ly6c2P0CW03 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ly6c2P0CW03 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ly6c2P0CW03 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ly6c2P0CW03 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ly6c2P0CW03 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ly6c2P0CW03 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ly6c2P0CW03 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ly6c2P0CW03 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ly6c2P0CW03 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ly6c2P0CW03 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ly6c2P0CW03 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ly6c2P0CW03 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ly6c2P0CW03 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ly6c2P0CW03 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ly6c2P0CW03 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ly6c2P0CW03 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ly6c2P0CW03 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ly6c2P0CW03 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ly6c2P0CW03 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ly6c2P0CW03 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ly6c2P0CW03 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ly6c2P0CW03 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ly6c2P0CW03 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ly6c2P0CW03 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ly6c2P0CW03 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ly6c2P0CW03 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ly6c2P0CW03 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ly6c2P0CW03 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ly6c2P0CW03 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ly6c2P0CW03 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ly6c2P0CW03 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ly6c2P0CW03 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ly6c2P0CW03 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ly6c2P0CW03 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ly6c2P0CW03 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ly6c2P0CW03 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ly6c2P0CW03 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ly6c2P0CW03 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ly6c2P0CW03 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ly6c2P0CW03 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms