Protein–RNA interactions for Protein: P0CG49

Ubb, Polyubiquitin-B, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbbP0CG49 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
UbbP0CG49 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
UbbP0CG49 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
UbbP0CG49 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
UbbP0CG49 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
UbbP0CG49 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UbbP0CG49 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UbbP0CG49 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UbbP0CG49 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UbbP0CG49 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
UbbP0CG49 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UbbP0CG49 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UbbP0CG49 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UbbP0CG49 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UbbP0CG49 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UbbP0CG49 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UbbP0CG49 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UbbP0CG49 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UbbP0CG49 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UbbP0CG49 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UbbP0CG49 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UbbP0CG49 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UbbP0CG49 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UbbP0CG49 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UbbP0CG49 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UbbP0CG49 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UbbP0CG49 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UbbP0CG49 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UbbP0CG49 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UbbP0CG49 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UbbP0CG49 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UbbP0CG49 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UbbP0CG49 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UbbP0CG49 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UbbP0CG49 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UbbP0CG49 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UbbP0CG49 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UbbP0CG49 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UbbP0CG49 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UbbP0CG49 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UbbP0CG49 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UbbP0CG49 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UbbP0CG49 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UbbP0CG49 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UbbP0CG49 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UbbP0CG49 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
UbbP0CG49 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UbbP0CG49 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UbbP0CG49 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UbbP0CG49 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
UbbP0CG49 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UbbP0CG49 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UbbP0CG49 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UbbP0CG49 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UbbP0CG49 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UbbP0CG49 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UbbP0CG49 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
UbbP0CG49 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
UbbP0CG49 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
UbbP0CG49 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
UbbP0CG49 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UbbP0CG49 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UbbP0CG49 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UbbP0CG49 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UbbP0CG49 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UbbP0CG49 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UbbP0CG49 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UbbP0CG49 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UbbP0CG49 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UbbP0CG49 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UbbP0CG49 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UbbP0CG49 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UbbP0CG49 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UbbP0CG49 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UbbP0CG49 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UbbP0CG49 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
UbbP0CG49 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UbbP0CG49 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UbbP0CG49 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UbbP0CG49 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UbbP0CG49 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UbbP0CG49 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UbbP0CG49 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UbbP0CG49 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
UbbP0CG49 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UbbP0CG49 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UbbP0CG49 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UbbP0CG49 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UbbP0CG49 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UbbP0CG49 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UbbP0CG49 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UbbP0CG49 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UbbP0CG49 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UbbP0CG49 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UbbP0CG49 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UbbP0CG49 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UbbP0CG49 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UbbP0CG49 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UbbP0CG49 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UbbP0CG49 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms