Protein–RNA interactions for Protein: P06328

Ig heavy chain V region VH558 B4, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06328 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P06328 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P06328 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P06328 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P06328 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P06328 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P06328 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P06328 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P06328 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P06328 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P06328 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P06328 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P06328 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P06328 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P06328 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P06328 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P06328 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P06328 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P06328 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P06328 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P06328 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
P06328 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P06328 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P06328 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P06328 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P06328 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P06328 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
P06328 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P06328 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
P06328 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P06328 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P06328 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P06328 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P06328 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P06328 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P06328 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P06328 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
P06328 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P06328 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P06328 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P06328 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P06328 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P06328 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P06328 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P06328 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P06328 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P06328 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06328 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06328 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06328 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06328 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06328 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06328 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06328 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06328 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06328 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P06328 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P06328 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P06328 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P06328 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P06328 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P06328 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P06328 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P06328 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P06328 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P06328 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P06328 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P06328 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P06328 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P06328 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P06328 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P06328 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P06328 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
P06328 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P06328 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P06328 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P06328 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P06328 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P06328 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P06328 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P06328 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P06328 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P06328 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P06328 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P06328 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P06328 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P06328 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P06328 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P06328 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P06328 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P06328 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P06328 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P06328 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P06328 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P06328 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P06328 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P06328 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P06328 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P06328 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P06328 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms