Protein–RNA interactions for Protein: P01790

Ig heavy chain V region M511, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01790 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01790 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
P01790 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01790 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01790 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01790 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01790 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01790 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01790 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01790 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01790 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01790 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01790 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
P01790 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01790 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01790 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01790 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01790 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01790 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01790 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01790 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01790 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01790 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01790 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01790 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01790 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01790 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01790 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01790 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
P01790 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01790 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01790 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01790 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01790 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01790 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01790 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01790 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01790 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01790 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01790 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01790 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01790 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01790 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01790 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01790 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01790 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01790 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01790 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01790 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01790 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01790 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01790 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01790 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01790 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01790 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01790 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01790 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
P01790 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01790 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01790 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01790 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01790 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01790 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01790 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01790 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01790 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01790 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01790 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01790 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01790 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01790 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01790 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01790 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01790 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01790 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
P01790 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01790 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01790 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01790 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01790 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01790 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01790 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01790 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01790 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01790 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01790 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01790 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01790 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01790 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01790 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01790 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01790 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01790 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01790 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01790 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01790 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01790 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01790 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01790 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01790 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms