Protein–RNA interactions for Protein: P01757

Ig heavy chain V region J558, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01757 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01757 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01757 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01757 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01757 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01757 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01757 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01757 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01757 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01757 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01757 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01757 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01757 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01757 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01757 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01757 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01757 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01757 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
P01757 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01757 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01757 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
P01757 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
P01757 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01757 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01757 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01757 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
P01757 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01757 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01757 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01757 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01757 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01757 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01757 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01757 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01757 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01757 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01757 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01757 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01757 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01757 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01757 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01757 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01757 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01757 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01757 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01757 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01757 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01757 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01757 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01757 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01757 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01757 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01757 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01757 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01757 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01757 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01757 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01757 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01757 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
P01757 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01757 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
P01757 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01757 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01757 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01757 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01757 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01757 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01757 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01757 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01757 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01757 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01757 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01757 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01757 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01757 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01757 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01757 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01757 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01757 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
P01757 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01757 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01757 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01757 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01757 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
P01757 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01757 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01757 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01757 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01757 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01757 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01757 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01757 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01757 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01757 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01757 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01757 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01757 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01757 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01757 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P01757 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms