Protein–RNA interactions for Protein: O88990

Actn3, Alpha-actinin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn3O88990 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Actn3O88990 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Actn3O88990 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Actn3O88990 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Actn3O88990 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Actn3O88990 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Actn3O88990 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Actn3O88990 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Actn3O88990 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Actn3O88990 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Actn3O88990 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Actn3O88990 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Actn3O88990 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Actn3O88990 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Actn3O88990 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Actn3O88990 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Actn3O88990 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Actn3O88990 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Actn3O88990 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Actn3O88990 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Actn3O88990 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Actn3O88990 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Actn3O88990 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Actn3O88990 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Actn3O88990 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Actn3O88990 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Actn3O88990 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Actn3O88990 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Actn3O88990 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Actn3O88990 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Actn3O88990 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Actn3O88990 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Actn3O88990 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Actn3O88990 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Actn3O88990 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Actn3O88990 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Actn3O88990 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Actn3O88990 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Actn3O88990 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Actn3O88990 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Actn3O88990 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Actn3O88990 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Actn3O88990 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Actn3O88990 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Actn3O88990 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Actn3O88990 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Actn3O88990 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Actn3O88990 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Actn3O88990 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Actn3O88990 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Actn3O88990 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Actn3O88990 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Actn3O88990 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Actn3O88990 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Actn3O88990 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Actn3O88990 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Actn3O88990 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Actn3O88990 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Actn3O88990 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Actn3O88990 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Actn3O88990 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Actn3O88990 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Actn3O88990 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Actn3O88990 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Actn3O88990 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Actn3O88990 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Actn3O88990 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Actn3O88990 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Actn3O88990 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Actn3O88990 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Actn3O88990 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Actn3O88990 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Actn3O88990 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Actn3O88990 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Actn3O88990 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Actn3O88990 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Actn3O88990 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Actn3O88990 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Actn3O88990 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Actn3O88990 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Actn3O88990 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Actn3O88990 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Actn3O88990 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Actn3O88990 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Actn3O88990 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Actn3O88990 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Actn3O88990 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Actn3O88990 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Actn3O88990 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Actn3O88990 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Actn3O88990 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Actn3O88990 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Actn3O88990 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Actn3O88990 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Actn3O88990 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Actn3O88990 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Actn3O88990 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Actn3O88990 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Actn3O88990 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Actn3O88990 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms