Protein–RNA interactions for Protein: O88983

Stx8, Syntaxin-8, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx8O88983 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Stx8O88983 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Stx8O88983 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Stx8O88983 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Stx8O88983 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Stx8O88983 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Stx8O88983 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Stx8O88983 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Stx8O88983 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Stx8O88983 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Stx8O88983 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Stx8O88983 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Stx8O88983 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Stx8O88983 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Stx8O88983 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Stx8O88983 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Stx8O88983 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Stx8O88983 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Stx8O88983 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Stx8O88983 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Stx8O88983 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Stx8O88983 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Stx8O88983 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Stx8O88983 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Stx8O88983 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Stx8O88983 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Stx8O88983 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Stx8O88983 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Stx8O88983 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Stx8O88983 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Stx8O88983 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Stx8O88983 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Stx8O88983 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Stx8O88983 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Stx8O88983 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Stx8O88983 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Stx8O88983 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Stx8O88983 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Stx8O88983 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Stx8O88983 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Stx8O88983 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Stx8O88983 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Stx8O88983 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Stx8O88983 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Stx8O88983 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Stx8O88983 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Stx8O88983 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Stx8O88983 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Stx8O88983 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Stx8O88983 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Stx8O88983 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Stx8O88983 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Stx8O88983 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Stx8O88983 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Stx8O88983 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Stx8O88983 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Stx8O88983 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Stx8O88983 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Stx8O88983 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Stx8O88983 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Stx8O88983 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Stx8O88983 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Stx8O88983 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Stx8O88983 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Stx8O88983 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Stx8O88983 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Stx8O88983 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Stx8O88983 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Stx8O88983 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Stx8O88983 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Stx8O88983 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Stx8O88983 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Stx8O88983 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Stx8O88983 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Stx8O88983 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Stx8O88983 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Stx8O88983 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Stx8O88983 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Stx8O88983 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Stx8O88983 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Stx8O88983 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Stx8O88983 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Stx8O88983 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Stx8O88983 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Stx8O88983 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Stx8O88983 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Stx8O88983 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Stx8O88983 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Stx8O88983 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Stx8O88983 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Stx8O88983 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Stx8O88983 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Stx8O88983 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Stx8O88983 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Stx8O88983 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Stx8O88983 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Stx8O88983 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Stx8O88983 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Stx8O88983 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Stx8O88983 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123.8 ms