Protein–RNA interactions for Protein: O88712

Ctbp1, C-terminal-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctbp1O88712 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ctbp1O88712 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ctbp1O88712 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctbp1O88712 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctbp1O88712 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctbp1O88712 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctbp1O88712 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctbp1O88712 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctbp1O88712 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctbp1O88712 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctbp1O88712 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctbp1O88712 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctbp1O88712 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctbp1O88712 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctbp1O88712 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctbp1O88712 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctbp1O88712 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctbp1O88712 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctbp1O88712 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctbp1O88712 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctbp1O88712 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctbp1O88712 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctbp1O88712 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctbp1O88712 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctbp1O88712 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctbp1O88712 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctbp1O88712 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctbp1O88712 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctbp1O88712 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctbp1O88712 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctbp1O88712 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctbp1O88712 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctbp1O88712 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctbp1O88712 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctbp1O88712 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctbp1O88712 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctbp1O88712 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctbp1O88712 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctbp1O88712 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctbp1O88712 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctbp1O88712 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctbp1O88712 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctbp1O88712 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctbp1O88712 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctbp1O88712 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctbp1O88712 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctbp1O88712 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctbp1O88712 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctbp1O88712 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctbp1O88712 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctbp1O88712 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctbp1O88712 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctbp1O88712 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctbp1O88712 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctbp1O88712 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctbp1O88712 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctbp1O88712 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctbp1O88712 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctbp1O88712 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctbp1O88712 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctbp1O88712 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctbp1O88712 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctbp1O88712 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctbp1O88712 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctbp1O88712 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctbp1O88712 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctbp1O88712 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctbp1O88712 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctbp1O88712 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctbp1O88712 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctbp1O88712 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctbp1O88712 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctbp1O88712 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctbp1O88712 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctbp1O88712 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctbp1O88712 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctbp1O88712 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctbp1O88712 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctbp1O88712 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctbp1O88712 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctbp1O88712 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctbp1O88712 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctbp1O88712 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctbp1O88712 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctbp1O88712 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctbp1O88712 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctbp1O88712 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctbp1O88712 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctbp1O88712 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctbp1O88712 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctbp1O88712 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctbp1O88712 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ctbp1O88712 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ctbp1O88712 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ctbp1O88712 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ctbp1O88712 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ctbp1O88712 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ctbp1O88712 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ctbp1O88712 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ctbp1O88712 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
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