Protein–RNA interactions for Protein: O70435

Psma3, Proteasome subunit alpha type-3, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma3O70435 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Psma3O70435 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Psma3O70435 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Psma3O70435 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Psma3O70435 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Psma3O70435 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Psma3O70435 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Psma3O70435 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Psma3O70435 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Psma3O70435 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Psma3O70435 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Psma3O70435 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Psma3O70435 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Psma3O70435 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Psma3O70435 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Psma3O70435 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Psma3O70435 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Psma3O70435 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Psma3O70435 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Psma3O70435 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Psma3O70435 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Psma3O70435 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Psma3O70435 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Psma3O70435 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Psma3O70435 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Psma3O70435 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Psma3O70435 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Psma3O70435 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Psma3O70435 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Psma3O70435 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Psma3O70435 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Psma3O70435 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Psma3O70435 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Psma3O70435 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Psma3O70435 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Psma3O70435 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Psma3O70435 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Psma3O70435 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Psma3O70435 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Psma3O70435 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Psma3O70435 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Psma3O70435 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Psma3O70435 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Psma3O70435 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Psma3O70435 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Psma3O70435 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Psma3O70435 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Psma3O70435 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Psma3O70435 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Psma3O70435 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Psma3O70435 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Psma3O70435 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Psma3O70435 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Psma3O70435 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Psma3O70435 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Psma3O70435 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Psma3O70435 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Psma3O70435 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Psma3O70435 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Psma3O70435 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Psma3O70435 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Psma3O70435 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Psma3O70435 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Psma3O70435 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Psma3O70435 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Psma3O70435 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Psma3O70435 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Psma3O70435 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Psma3O70435 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Psma3O70435 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Psma3O70435 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Psma3O70435 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Psma3O70435 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Psma3O70435 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Psma3O70435 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Psma3O70435 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Psma3O70435 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Psma3O70435 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Psma3O70435 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Psma3O70435 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Psma3O70435 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Psma3O70435 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Psma3O70435 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Psma3O70435 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Psma3O70435 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Psma3O70435 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Psma3O70435 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Psma3O70435 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Psma3O70435 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Psma3O70435 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Psma3O70435 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psma3O70435 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psma3O70435 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psma3O70435 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psma3O70435 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psma3O70435 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psma3O70435 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Psma3O70435 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psma3O70435 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psma3O70435 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms