Protein–RNA interactions for Protein: O70174

Chrna4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna4O70174 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chrna4O70174 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Chrna4O70174 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chrna4O70174 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chrna4O70174 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Chrna4O70174 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chrna4O70174 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chrna4O70174 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chrna4O70174 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chrna4O70174 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chrna4O70174 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chrna4O70174 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chrna4O70174 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chrna4O70174 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chrna4O70174 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chrna4O70174 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chrna4O70174 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chrna4O70174 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chrna4O70174 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chrna4O70174 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chrna4O70174 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chrna4O70174 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chrna4O70174 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chrna4O70174 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Chrna4O70174 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chrna4O70174 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chrna4O70174 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chrna4O70174 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Chrna4O70174 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chrna4O70174 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chrna4O70174 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chrna4O70174 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chrna4O70174 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chrna4O70174 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chrna4O70174 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chrna4O70174 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chrna4O70174 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chrna4O70174 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chrna4O70174 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chrna4O70174 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chrna4O70174 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chrna4O70174 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chrna4O70174 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chrna4O70174 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chrna4O70174 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chrna4O70174 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chrna4O70174 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chrna4O70174 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chrna4O70174 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chrna4O70174 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chrna4O70174 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chrna4O70174 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chrna4O70174 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chrna4O70174 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chrna4O70174 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chrna4O70174 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chrna4O70174 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chrna4O70174 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chrna4O70174 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chrna4O70174 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chrna4O70174 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chrna4O70174 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chrna4O70174 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Chrna4O70174 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chrna4O70174 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Chrna4O70174 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chrna4O70174 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chrna4O70174 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chrna4O70174 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chrna4O70174 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Chrna4O70174 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chrna4O70174 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chrna4O70174 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chrna4O70174 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chrna4O70174 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chrna4O70174 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Chrna4O70174 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chrna4O70174 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chrna4O70174 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Chrna4O70174 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Chrna4O70174 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chrna4O70174 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.32■■□□□ 1
Chrna4O70174 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Chrna4O70174 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Chrna4O70174 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chrna4O70174 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chrna4O70174 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chrna4O70174 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chrna4O70174 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Chrna4O70174 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chrna4O70174 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chrna4O70174 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chrna4O70174 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Chrna4O70174 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chrna4O70174 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Chrna4O70174 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Chrna4O70174 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Chrna4O70174 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Chrna4O70174 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chrna4O70174 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms