Protein–RNA interactions for Protein: O70172

Pip4k2a, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pip4k2aO70172 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pip4k2aO70172 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pip4k2aO70172 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pip4k2aO70172 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pip4k2aO70172 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pip4k2aO70172 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pip4k2aO70172 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pip4k2aO70172 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pip4k2aO70172 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pip4k2aO70172 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pip4k2aO70172 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pip4k2aO70172 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pip4k2aO70172 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pip4k2aO70172 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pip4k2aO70172 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pip4k2aO70172 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pip4k2aO70172 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pip4k2aO70172 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pip4k2aO70172 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pip4k2aO70172 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pip4k2aO70172 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pip4k2aO70172 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pip4k2aO70172 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Pip4k2aO70172 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pip4k2aO70172 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pip4k2aO70172 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Pip4k2aO70172 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pip4k2aO70172 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pip4k2aO70172 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Pip4k2aO70172 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Pip4k2aO70172 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Pip4k2aO70172 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pip4k2aO70172 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pip4k2aO70172 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pip4k2aO70172 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pip4k2aO70172 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pip4k2aO70172 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pip4k2aO70172 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Pip4k2aO70172 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pip4k2aO70172 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pip4k2aO70172 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pip4k2aO70172 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pip4k2aO70172 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pip4k2aO70172 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pip4k2aO70172 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pip4k2aO70172 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pip4k2aO70172 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pip4k2aO70172 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pip4k2aO70172 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pip4k2aO70172 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pip4k2aO70172 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pip4k2aO70172 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pip4k2aO70172 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pip4k2aO70172 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pip4k2aO70172 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pip4k2aO70172 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pip4k2aO70172 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pip4k2aO70172 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pip4k2aO70172 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pip4k2aO70172 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pip4k2aO70172 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pip4k2aO70172 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pip4k2aO70172 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pip4k2aO70172 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pip4k2aO70172 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pip4k2aO70172 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pip4k2aO70172 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pip4k2aO70172 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pip4k2aO70172 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pip4k2aO70172 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pip4k2aO70172 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pip4k2aO70172 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pip4k2aO70172 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pip4k2aO70172 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Pip4k2aO70172 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pip4k2aO70172 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pip4k2aO70172 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pip4k2aO70172 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pip4k2aO70172 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pip4k2aO70172 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pip4k2aO70172 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pip4k2aO70172 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pip4k2aO70172 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pip4k2aO70172 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pip4k2aO70172 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pip4k2aO70172 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pip4k2aO70172 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pip4k2aO70172 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pip4k2aO70172 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pip4k2aO70172 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pip4k2aO70172 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pip4k2aO70172 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pip4k2aO70172 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pip4k2aO70172 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pip4k2aO70172 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pip4k2aO70172 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pip4k2aO70172 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pip4k2aO70172 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pip4k2aO70172 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pip4k2aO70172 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms