Protein–RNA interactions for Protein: O54818

Tpd52l1, Tumor protein D53, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpd52l1O54818 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tpd52l1O54818 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tpd52l1O54818 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Tpd52l1O54818 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tpd52l1O54818 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tpd52l1O54818 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tpd52l1O54818 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tpd52l1O54818 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tpd52l1O54818 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tpd52l1O54818 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tpd52l1O54818 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tpd52l1O54818 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tpd52l1O54818 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tpd52l1O54818 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tpd52l1O54818 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tpd52l1O54818 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tpd52l1O54818 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tpd52l1O54818 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Tpd52l1O54818 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tpd52l1O54818 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Tpd52l1O54818 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tpd52l1O54818 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tpd52l1O54818 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tpd52l1O54818 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tpd52l1O54818 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tpd52l1O54818 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tpd52l1O54818 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tpd52l1O54818 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tpd52l1O54818 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tpd52l1O54818 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tpd52l1O54818 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tpd52l1O54818 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tpd52l1O54818 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tpd52l1O54818 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tpd52l1O54818 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tpd52l1O54818 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tpd52l1O54818 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tpd52l1O54818 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tpd52l1O54818 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tpd52l1O54818 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tpd52l1O54818 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tpd52l1O54818 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tpd52l1O54818 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tpd52l1O54818 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tpd52l1O54818 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tpd52l1O54818 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tpd52l1O54818 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tpd52l1O54818 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tpd52l1O54818 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tpd52l1O54818 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tpd52l1O54818 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tpd52l1O54818 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tpd52l1O54818 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tpd52l1O54818 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tpd52l1O54818 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tpd52l1O54818 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tpd52l1O54818 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tpd52l1O54818 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tpd52l1O54818 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tpd52l1O54818 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Tpd52l1O54818 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tpd52l1O54818 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tpd52l1O54818 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tpd52l1O54818 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tpd52l1O54818 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tpd52l1O54818 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tpd52l1O54818 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tpd52l1O54818 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tpd52l1O54818 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tpd52l1O54818 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tpd52l1O54818 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tpd52l1O54818 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tpd52l1O54818 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tpd52l1O54818 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tpd52l1O54818 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tpd52l1O54818 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tpd52l1O54818 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tpd52l1O54818 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tpd52l1O54818 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tpd52l1O54818 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tpd52l1O54818 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tpd52l1O54818 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tpd52l1O54818 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tpd52l1O54818 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tpd52l1O54818 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tpd52l1O54818 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tpd52l1O54818 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tpd52l1O54818 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tpd52l1O54818 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Tpd52l1O54818 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tpd52l1O54818 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Tpd52l1O54818 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tpd52l1O54818 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tpd52l1O54818 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tpd52l1O54818 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tpd52l1O54818 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tpd52l1O54818 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tpd52l1O54818 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tpd52l1O54818 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tpd52l1O54818 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms