Protein–RNA interactions for Protein: O35902

Dsg3, Desmoglein-3, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg3O35902 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dsg3O35902 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dsg3O35902 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dsg3O35902 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dsg3O35902 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dsg3O35902 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dsg3O35902 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dsg3O35902 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dsg3O35902 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dsg3O35902 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dsg3O35902 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dsg3O35902 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dsg3O35902 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dsg3O35902 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dsg3O35902 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dsg3O35902 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dsg3O35902 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dsg3O35902 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dsg3O35902 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dsg3O35902 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dsg3O35902 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dsg3O35902 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dsg3O35902 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dsg3O35902 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dsg3O35902 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dsg3O35902 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dsg3O35902 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dsg3O35902 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dsg3O35902 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dsg3O35902 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dsg3O35902 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dsg3O35902 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dsg3O35902 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dsg3O35902 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Dsg3O35902 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dsg3O35902 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dsg3O35902 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dsg3O35902 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dsg3O35902 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dsg3O35902 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dsg3O35902 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Dsg3O35902 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dsg3O35902 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dsg3O35902 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dsg3O35902 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dsg3O35902 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dsg3O35902 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dsg3O35902 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dsg3O35902 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dsg3O35902 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dsg3O35902 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dsg3O35902 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dsg3O35902 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dsg3O35902 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dsg3O35902 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dsg3O35902 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dsg3O35902 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dsg3O35902 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dsg3O35902 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dsg3O35902 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dsg3O35902 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dsg3O35902 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dsg3O35902 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Dsg3O35902 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dsg3O35902 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dsg3O35902 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dsg3O35902 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dsg3O35902 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dsg3O35902 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dsg3O35902 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dsg3O35902 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dsg3O35902 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dsg3O35902 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dsg3O35902 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Dsg3O35902 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dsg3O35902 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dsg3O35902 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dsg3O35902 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dsg3O35902 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Dsg3O35902 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dsg3O35902 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dsg3O35902 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dsg3O35902 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dsg3O35902 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dsg3O35902 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dsg3O35902 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dsg3O35902 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dsg3O35902 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dsg3O35902 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dsg3O35902 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dsg3O35902 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dsg3O35902 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dsg3O35902 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Dsg3O35902 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Dsg3O35902 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dsg3O35902 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dsg3O35902 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dsg3O35902 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dsg3O35902 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dsg3O35902 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms