Protein–RNA interactions for Protein: O35685

Nudc, Nuclear migration protein nudC, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NudcO35685 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NudcO35685 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NudcO35685 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NudcO35685 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NudcO35685 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NudcO35685 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NudcO35685 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NudcO35685 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NudcO35685 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NudcO35685 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NudcO35685 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NudcO35685 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NudcO35685 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NudcO35685 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NudcO35685 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NudcO35685 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NudcO35685 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NudcO35685 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NudcO35685 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NudcO35685 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
NudcO35685 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NudcO35685 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NudcO35685 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
NudcO35685 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NudcO35685 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NudcO35685 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NudcO35685 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NudcO35685 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NudcO35685 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
NudcO35685 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
NudcO35685 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
NudcO35685 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NudcO35685 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NudcO35685 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NudcO35685 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NudcO35685 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NudcO35685 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NudcO35685 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NudcO35685 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NudcO35685 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NudcO35685 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NudcO35685 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NudcO35685 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NudcO35685 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NudcO35685 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NudcO35685 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NudcO35685 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NudcO35685 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NudcO35685 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NudcO35685 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NudcO35685 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NudcO35685 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NudcO35685 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NudcO35685 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
NudcO35685 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NudcO35685 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NudcO35685 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NudcO35685 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NudcO35685 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NudcO35685 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NudcO35685 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NudcO35685 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NudcO35685 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NudcO35685 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NudcO35685 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NudcO35685 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NudcO35685 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NudcO35685 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NudcO35685 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NudcO35685 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NudcO35685 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
NudcO35685 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NudcO35685 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NudcO35685 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NudcO35685 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NudcO35685 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NudcO35685 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NudcO35685 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NudcO35685 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NudcO35685 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NudcO35685 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NudcO35685 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
NudcO35685 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NudcO35685 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NudcO35685 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NudcO35685 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NudcO35685 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NudcO35685 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
NudcO35685 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NudcO35685 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NudcO35685 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NudcO35685 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NudcO35685 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NudcO35685 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NudcO35685 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NudcO35685 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NudcO35685 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NudcO35685 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NudcO35685 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
NudcO35685 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72 ms