Protein–RNA interactions for Protein: O35664

Ifnar2, Interferon alpha/beta receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnar2O35664 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ifnar2O35664 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ifnar2O35664 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ifnar2O35664 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ifnar2O35664 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ifnar2O35664 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ifnar2O35664 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ifnar2O35664 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ifnar2O35664 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ifnar2O35664 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ifnar2O35664 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ifnar2O35664 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ifnar2O35664 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ifnar2O35664 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ifnar2O35664 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ifnar2O35664 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ifnar2O35664 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ifnar2O35664 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ifnar2O35664 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ifnar2O35664 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ifnar2O35664 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ifnar2O35664 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ifnar2O35664 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ifnar2O35664 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ifnar2O35664 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ifnar2O35664 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ifnar2O35664 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ifnar2O35664 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ifnar2O35664 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ifnar2O35664 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ifnar2O35664 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ifnar2O35664 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ifnar2O35664 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ifnar2O35664 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ifnar2O35664 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ifnar2O35664 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ifnar2O35664 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ifnar2O35664 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ifnar2O35664 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ifnar2O35664 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ifnar2O35664 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ifnar2O35664 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ifnar2O35664 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ifnar2O35664 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ifnar2O35664 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ifnar2O35664 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ifnar2O35664 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ifnar2O35664 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ifnar2O35664 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ifnar2O35664 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ifnar2O35664 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ifnar2O35664 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ifnar2O35664 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ifnar2O35664 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ifnar2O35664 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ifnar2O35664 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ifnar2O35664 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ifnar2O35664 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ifnar2O35664 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ifnar2O35664 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ifnar2O35664 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ifnar2O35664 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ifnar2O35664 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ifnar2O35664 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ifnar2O35664 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ifnar2O35664 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ifnar2O35664 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ifnar2O35664 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ifnar2O35664 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ifnar2O35664 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ifnar2O35664 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ifnar2O35664 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ifnar2O35664 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ifnar2O35664 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ifnar2O35664 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ifnar2O35664 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ifnar2O35664 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ifnar2O35664 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ifnar2O35664 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ifnar2O35664 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ifnar2O35664 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ifnar2O35664 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ifnar2O35664 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ifnar2O35664 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ifnar2O35664 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ifnar2O35664 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ifnar2O35664 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ifnar2O35664 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ifnar2O35664 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ifnar2O35664 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ifnar2O35664 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ifnar2O35664 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ifnar2O35664 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ifnar2O35664 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ifnar2O35664 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ifnar2O35664 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ifnar2O35664 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ifnar2O35664 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ifnar2O35664 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ifnar2O35664 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms