Protein–RNA interactions for Protein: O35464

Sema6a, Semaphorin-6A, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6aO35464 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sema6aO35464 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sema6aO35464 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sema6aO35464 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Sema6aO35464 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Sema6aO35464 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sema6aO35464 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sema6aO35464 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sema6aO35464 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sema6aO35464 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sema6aO35464 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sema6aO35464 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sema6aO35464 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Sema6aO35464 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Sema6aO35464 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Sema6aO35464 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sema6aO35464 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sema6aO35464 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sema6aO35464 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sema6aO35464 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sema6aO35464 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sema6aO35464 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sema6aO35464 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sema6aO35464 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sema6aO35464 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sema6aO35464 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sema6aO35464 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sema6aO35464 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sema6aO35464 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sema6aO35464 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sema6aO35464 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sema6aO35464 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sema6aO35464 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Sema6aO35464 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Sema6aO35464 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sema6aO35464 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Sema6aO35464 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sema6aO35464 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sema6aO35464 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sema6aO35464 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sema6aO35464 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sema6aO35464 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sema6aO35464 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sema6aO35464 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sema6aO35464 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sema6aO35464 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sema6aO35464 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sema6aO35464 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sema6aO35464 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sema6aO35464 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sema6aO35464 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sema6aO35464 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sema6aO35464 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sema6aO35464 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sema6aO35464 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sema6aO35464 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sema6aO35464 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sema6aO35464 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sema6aO35464 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sema6aO35464 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sema6aO35464 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sema6aO35464 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sema6aO35464 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sema6aO35464 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sema6aO35464 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sema6aO35464 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sema6aO35464 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sema6aO35464 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sema6aO35464 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sema6aO35464 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sema6aO35464 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Sema6aO35464 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sema6aO35464 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sema6aO35464 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sema6aO35464 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sema6aO35464 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sema6aO35464 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sema6aO35464 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sema6aO35464 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sema6aO35464 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sema6aO35464 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sema6aO35464 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sema6aO35464 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Sema6aO35464 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sema6aO35464 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sema6aO35464 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sema6aO35464 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sema6aO35464 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sema6aO35464 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sema6aO35464 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sema6aO35464 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Sema6aO35464 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sema6aO35464 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sema6aO35464 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sema6aO35464 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sema6aO35464 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sema6aO35464 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sema6aO35464 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sema6aO35464 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sema6aO35464 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms