Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pitx3O35160 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pitx3O35160 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pitx3O35160 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pitx3O35160 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pitx3O35160 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pitx3O35160 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pitx3O35160 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pitx3O35160 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pitx3O35160 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pitx3O35160 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pitx3O35160 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pitx3O35160 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pitx3O35160 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pitx3O35160 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pitx3O35160 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pitx3O35160 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pitx3O35160 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pitx3O35160 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pitx3O35160 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pitx3O35160 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pitx3O35160 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pitx3O35160 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pitx3O35160 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pitx3O35160 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pitx3O35160 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Pitx3O35160 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pitx3O35160 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pitx3O35160 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pitx3O35160 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pitx3O35160 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pitx3O35160 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pitx3O35160 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pitx3O35160 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pitx3O35160 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pitx3O35160 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pitx3O35160 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Pitx3O35160 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pitx3O35160 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pitx3O35160 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pitx3O35160 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pitx3O35160 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pitx3O35160 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Pitx3O35160 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pitx3O35160 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pitx3O35160 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pitx3O35160 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pitx3O35160 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pitx3O35160 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pitx3O35160 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Pitx3O35160 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pitx3O35160 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pitx3O35160 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pitx3O35160 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pitx3O35160 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pitx3O35160 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pitx3O35160 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pitx3O35160 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pitx3O35160 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pitx3O35160 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pitx3O35160 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pitx3O35160 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pitx3O35160 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pitx3O35160 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pitx3O35160 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pitx3O35160 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pitx3O35160 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Pitx3O35160 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pitx3O35160 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pitx3O35160 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pitx3O35160 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pitx3O35160 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pitx3O35160 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pitx3O35160 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pitx3O35160 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pitx3O35160 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Pitx3O35160 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Pitx3O35160 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pitx3O35160 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pitx3O35160 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pitx3O35160 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pitx3O35160 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pitx3O35160 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pitx3O35160 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pitx3O35160 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pitx3O35160 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pitx3O35160 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pitx3O35160 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pitx3O35160 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Pitx3O35160 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pitx3O35160 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pitx3O35160 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pitx3O35160 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pitx3O35160 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pitx3O35160 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pitx3O35160 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pitx3O35160 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pitx3O35160 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pitx3O35160 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pitx3O35160 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms