Protein–RNA interactions for Protein: O09161

Casq2, Calsequestrin-2, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq2O09161 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Casq2O09161 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Casq2O09161 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Casq2O09161 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Casq2O09161 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Casq2O09161 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Casq2O09161 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Casq2O09161 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Casq2O09161 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Casq2O09161 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Casq2O09161 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Casq2O09161 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Casq2O09161 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Casq2O09161 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Casq2O09161 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Casq2O09161 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Casq2O09161 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Casq2O09161 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Casq2O09161 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Casq2O09161 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Casq2O09161 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Casq2O09161 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Casq2O09161 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Casq2O09161 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Casq2O09161 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Casq2O09161 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Casq2O09161 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Casq2O09161 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Casq2O09161 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Casq2O09161 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Casq2O09161 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Casq2O09161 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Casq2O09161 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Casq2O09161 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Casq2O09161 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Casq2O09161 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Casq2O09161 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Casq2O09161 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Casq2O09161 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Casq2O09161 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Casq2O09161 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Casq2O09161 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Casq2O09161 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Casq2O09161 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Casq2O09161 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Casq2O09161 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Casq2O09161 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Casq2O09161 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Casq2O09161 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Casq2O09161 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Casq2O09161 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Casq2O09161 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Casq2O09161 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Casq2O09161 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Casq2O09161 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Casq2O09161 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Casq2O09161 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Casq2O09161 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Casq2O09161 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Casq2O09161 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Casq2O09161 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Casq2O09161 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Casq2O09161 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Casq2O09161 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Casq2O09161 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Casq2O09161 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Casq2O09161 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Casq2O09161 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Casq2O09161 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Casq2O09161 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Casq2O09161 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Casq2O09161 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Casq2O09161 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Casq2O09161 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Casq2O09161 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Casq2O09161 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Casq2O09161 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Casq2O09161 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Casq2O09161 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Casq2O09161 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Casq2O09161 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Casq2O09161 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Casq2O09161 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Casq2O09161 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Casq2O09161 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Casq2O09161 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Casq2O09161 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Casq2O09161 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Casq2O09161 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Casq2O09161 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Casq2O09161 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Casq2O09161 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Casq2O09161 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Casq2O09161 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Casq2O09161 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Casq2O09161 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Casq2O09161 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Casq2O09161 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Casq2O09161 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Casq2O09161 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
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