Protein–RNA interactions for Protein: O08584

Klf6, Krueppel-like factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf6O08584 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Klf6O08584 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Klf6O08584 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Klf6O08584 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Klf6O08584 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Klf6O08584 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Klf6O08584 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Klf6O08584 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Klf6O08584 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Klf6O08584 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Klf6O08584 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Klf6O08584 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Klf6O08584 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Klf6O08584 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Klf6O08584 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Klf6O08584 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Klf6O08584 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Klf6O08584 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Klf6O08584 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Klf6O08584 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Klf6O08584 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Klf6O08584 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Klf6O08584 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Klf6O08584 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Klf6O08584 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Klf6O08584 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Klf6O08584 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Klf6O08584 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Klf6O08584 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Klf6O08584 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Klf6O08584 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Klf6O08584 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Klf6O08584 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Klf6O08584 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Klf6O08584 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Klf6O08584 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Klf6O08584 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Klf6O08584 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Klf6O08584 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Klf6O08584 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Klf6O08584 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Klf6O08584 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Klf6O08584 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Klf6O08584 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Klf6O08584 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Klf6O08584 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Klf6O08584 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Klf6O08584 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Klf6O08584 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Klf6O08584 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Klf6O08584 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Klf6O08584 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Klf6O08584 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Klf6O08584 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Klf6O08584 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Klf6O08584 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Klf6O08584 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Klf6O08584 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Klf6O08584 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Klf6O08584 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Klf6O08584 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Klf6O08584 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Klf6O08584 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Klf6O08584 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Klf6O08584 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Klf6O08584 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Klf6O08584 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Klf6O08584 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Klf6O08584 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Klf6O08584 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Klf6O08584 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Klf6O08584 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Klf6O08584 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Klf6O08584 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Klf6O08584 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Klf6O08584 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Klf6O08584 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Klf6O08584 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Klf6O08584 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Klf6O08584 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Klf6O08584 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Klf6O08584 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Klf6O08584 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Klf6O08584 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Klf6O08584 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Klf6O08584 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Klf6O08584 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Klf6O08584 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Klf6O08584 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Klf6O08584 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Klf6O08584 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klf6O08584 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klf6O08584 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klf6O08584 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klf6O08584 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klf6O08584 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klf6O08584 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klf6O08584 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Klf6O08584 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Klf6O08584 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms