Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ23

Gm21310, Predicted gene, 21310, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21310J3QQ23 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm21310J3QQ23 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm21310J3QQ23 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm21310J3QQ23 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm21310J3QQ23 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm21310J3QQ23 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm21310J3QQ23 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Gm21310J3QQ23 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm21310J3QQ23 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm21310J3QQ23 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm21310J3QQ23 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm21310J3QQ23 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm21310J3QQ23 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm21310J3QQ23 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm21310J3QQ23 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm21310J3QQ23 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm21310J3QQ23 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm21310J3QQ23 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm21310J3QQ23 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm21310J3QQ23 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm21310J3QQ23 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm21310J3QQ23 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm21310J3QQ23 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm21310J3QQ23 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm21310J3QQ23 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm21310J3QQ23 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm21310J3QQ23 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm21310J3QQ23 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm21310J3QQ23 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm21310J3QQ23 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm21310J3QQ23 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm21310J3QQ23 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm21310J3QQ23 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm21310J3QQ23 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm21310J3QQ23 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm21310J3QQ23 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Gm21310J3QQ23 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm21310J3QQ23 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm21310J3QQ23 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm21310J3QQ23 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm21310J3QQ23 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm21310J3QQ23 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm21310J3QQ23 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm21310J3QQ23 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm21310J3QQ23 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm21310J3QQ23 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm21310J3QQ23 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Gm21310J3QQ23 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm21310J3QQ23 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Gm21310J3QQ23 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Gm21310J3QQ23 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm21310J3QQ23 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm21310J3QQ23 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Gm21310J3QQ23 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm21310J3QQ23 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm21310J3QQ23 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21310J3QQ23 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21310J3QQ23 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21310J3QQ23 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21310J3QQ23 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21310J3QQ23 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21310J3QQ23 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21310J3QQ23 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21310J3QQ23 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21310J3QQ23 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21310J3QQ23 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21310J3QQ23 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21310J3QQ23 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
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Gm21310J3QQ23 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm21310J3QQ23 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
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Gm21310J3QQ23 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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