Protein–RNA interactions for Protein: J3QPX0

5730507C01Rik, RIKEN cDNA 5730507C01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5730507C01RikJ3QPX0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
5730507C01RikJ3QPX0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
5730507C01RikJ3QPX0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
5730507C01RikJ3QPX0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
5730507C01RikJ3QPX0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
5730507C01RikJ3QPX0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
5730507C01RikJ3QPX0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
5730507C01RikJ3QPX0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
5730507C01RikJ3QPX0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
5730507C01RikJ3QPX0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
5730507C01RikJ3QPX0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
5730507C01RikJ3QPX0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
5730507C01RikJ3QPX0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
5730507C01RikJ3QPX0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
5730507C01RikJ3QPX0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
5730507C01RikJ3QPX0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
5730507C01RikJ3QPX0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
5730507C01RikJ3QPX0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
5730507C01RikJ3QPX0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
5730507C01RikJ3QPX0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
5730507C01RikJ3QPX0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
5730507C01RikJ3QPX0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
5730507C01RikJ3QPX0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
5730507C01RikJ3QPX0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
5730507C01RikJ3QPX0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
5730507C01RikJ3QPX0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
5730507C01RikJ3QPX0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
5730507C01RikJ3QPX0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
5730507C01RikJ3QPX0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
5730507C01RikJ3QPX0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
5730507C01RikJ3QPX0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
5730507C01RikJ3QPX0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
5730507C01RikJ3QPX0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
5730507C01RikJ3QPX0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
5730507C01RikJ3QPX0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
5730507C01RikJ3QPX0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
5730507C01RikJ3QPX0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
5730507C01RikJ3QPX0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
5730507C01RikJ3QPX0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
5730507C01RikJ3QPX0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
5730507C01RikJ3QPX0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
5730507C01RikJ3QPX0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
5730507C01RikJ3QPX0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
5730507C01RikJ3QPX0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
5730507C01RikJ3QPX0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
5730507C01RikJ3QPX0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
5730507C01RikJ3QPX0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
5730507C01RikJ3QPX0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
5730507C01RikJ3QPX0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
5730507C01RikJ3QPX0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
5730507C01RikJ3QPX0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
5730507C01RikJ3QPX0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
5730507C01RikJ3QPX0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
5730507C01RikJ3QPX0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
5730507C01RikJ3QPX0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
5730507C01RikJ3QPX0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
5730507C01RikJ3QPX0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
5730507C01RikJ3QPX0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
5730507C01RikJ3QPX0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
5730507C01RikJ3QPX0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
5730507C01RikJ3QPX0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
5730507C01RikJ3QPX0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
5730507C01RikJ3QPX0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
5730507C01RikJ3QPX0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
5730507C01RikJ3QPX0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
5730507C01RikJ3QPX0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
5730507C01RikJ3QPX0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
5730507C01RikJ3QPX0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
5730507C01RikJ3QPX0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
5730507C01RikJ3QPX0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
5730507C01RikJ3QPX0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
5730507C01RikJ3QPX0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
5730507C01RikJ3QPX0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
5730507C01RikJ3QPX0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
5730507C01RikJ3QPX0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
5730507C01RikJ3QPX0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
5730507C01RikJ3QPX0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
5730507C01RikJ3QPX0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
5730507C01RikJ3QPX0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
5730507C01RikJ3QPX0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
5730507C01RikJ3QPX0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
5730507C01RikJ3QPX0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
5730507C01RikJ3QPX0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
5730507C01RikJ3QPX0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
5730507C01RikJ3QPX0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
5730507C01RikJ3QPX0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
5730507C01RikJ3QPX0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
5730507C01RikJ3QPX0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
5730507C01RikJ3QPX0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
5730507C01RikJ3QPX0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
5730507C01RikJ3QPX0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
5730507C01RikJ3QPX0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
5730507C01RikJ3QPX0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
5730507C01RikJ3QPX0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
5730507C01RikJ3QPX0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
5730507C01RikJ3QPX0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
5730507C01RikJ3QPX0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
5730507C01RikJ3QPX0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
5730507C01RikJ3QPX0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
5730507C01RikJ3QPX0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms