Protein–RNA interactions for Protein: J3QNR8

Trim34b, Tripartite motif-containing 34B, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim34bJ3QNR8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trim34bJ3QNR8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trim34bJ3QNR8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trim34bJ3QNR8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trim34bJ3QNR8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trim34bJ3QNR8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trim34bJ3QNR8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trim34bJ3QNR8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trim34bJ3QNR8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trim34bJ3QNR8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Trim34bJ3QNR8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Trim34bJ3QNR8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trim34bJ3QNR8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trim34bJ3QNR8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trim34bJ3QNR8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trim34bJ3QNR8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trim34bJ3QNR8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Trim34bJ3QNR8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trim34bJ3QNR8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trim34bJ3QNR8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Trim34bJ3QNR8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trim34bJ3QNR8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trim34bJ3QNR8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trim34bJ3QNR8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trim34bJ3QNR8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trim34bJ3QNR8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trim34bJ3QNR8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trim34bJ3QNR8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trim34bJ3QNR8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trim34bJ3QNR8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trim34bJ3QNR8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trim34bJ3QNR8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trim34bJ3QNR8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trim34bJ3QNR8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trim34bJ3QNR8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trim34bJ3QNR8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trim34bJ3QNR8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trim34bJ3QNR8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trim34bJ3QNR8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trim34bJ3QNR8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trim34bJ3QNR8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trim34bJ3QNR8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trim34bJ3QNR8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trim34bJ3QNR8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trim34bJ3QNR8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trim34bJ3QNR8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trim34bJ3QNR8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trim34bJ3QNR8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trim34bJ3QNR8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trim34bJ3QNR8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Trim34bJ3QNR8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trim34bJ3QNR8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trim34bJ3QNR8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trim34bJ3QNR8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trim34bJ3QNR8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Trim34bJ3QNR8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Trim34bJ3QNR8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Trim34bJ3QNR8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Trim34bJ3QNR8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Trim34bJ3QNR8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Trim34bJ3QNR8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Trim34bJ3QNR8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Trim34bJ3QNR8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Trim34bJ3QNR8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Trim34bJ3QNR8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trim34bJ3QNR8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trim34bJ3QNR8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trim34bJ3QNR8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trim34bJ3QNR8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trim34bJ3QNR8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Trim34bJ3QNR8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Trim34bJ3QNR8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Trim34bJ3QNR8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Trim34bJ3QNR8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Trim34bJ3QNR8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Trim34bJ3QNR8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Trim34bJ3QNR8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trim34bJ3QNR8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trim34bJ3QNR8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trim34bJ3QNR8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trim34bJ3QNR8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trim34bJ3QNR8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trim34bJ3QNR8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trim34bJ3QNR8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trim34bJ3QNR8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trim34bJ3QNR8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trim34bJ3QNR8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trim34bJ3QNR8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trim34bJ3QNR8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Trim34bJ3QNR8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trim34bJ3QNR8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Trim34bJ3QNR8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Trim34bJ3QNR8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Trim34bJ3QNR8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Trim34bJ3QNR8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Trim34bJ3QNR8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Trim34bJ3QNR8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Trim34bJ3QNR8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Trim34bJ3QNR8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Trim34bJ3QNR8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms