Protein–RNA interactions for Protein: G5E8P0

Tubgcp6, Gamma-tubulin complex component 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp6G5E8P0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Tubgcp6G5E8P0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.44
Tubgcp6G5E8P0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Tubgcp6G5E8P0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.44
Tubgcp6G5E8P0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Tubgcp6G5E8P0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Tubgcp6G5E8P0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Tubgcp6G5E8P0 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Tubgcp6G5E8P0 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Tubgcp6G5E8P0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Tubgcp6G5E8P0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Tubgcp6G5E8P0 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Tubgcp6G5E8P0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Tubgcp6G5E8P0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Tubgcp6G5E8P0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Tubgcp6G5E8P0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Tubgcp6G5E8P0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
Tubgcp6G5E8P0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Tubgcp6G5E8P0 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Tubgcp6G5E8P0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Tubgcp6G5E8P0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Tubgcp6G5E8P0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Tubgcp6G5E8P0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Tubgcp6G5E8P0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Tubgcp6G5E8P0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Tubgcp6G5E8P0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
Tubgcp6G5E8P0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Tubgcp6G5E8P0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Tubgcp6G5E8P0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Tubgcp6G5E8P0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Tubgcp6G5E8P0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Tubgcp6G5E8P0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Tubgcp6G5E8P0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Tubgcp6G5E8P0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Tubgcp6G5E8P0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Tubgcp6G5E8P0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Tubgcp6G5E8P0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Tubgcp6G5E8P0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Tubgcp6G5E8P0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
Tubgcp6G5E8P0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Tubgcp6G5E8P0 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Tubgcp6G5E8P0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Tubgcp6G5E8P0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Tubgcp6G5E8P0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Tubgcp6G5E8P0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Tubgcp6G5E8P0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Tubgcp6G5E8P0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Tubgcp6G5E8P0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Tubgcp6G5E8P0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Tubgcp6G5E8P0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Tubgcp6G5E8P0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
Tubgcp6G5E8P0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Tubgcp6G5E8P0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Tubgcp6G5E8P0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Tubgcp6G5E8P0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Tubgcp6G5E8P0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Tubgcp6G5E8P0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Tubgcp6G5E8P0 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Tubgcp6G5E8P0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Tubgcp6G5E8P0 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
Tubgcp6G5E8P0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Tubgcp6G5E8P0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Tubgcp6G5E8P0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
Tubgcp6G5E8P0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Tubgcp6G5E8P0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Tubgcp6G5E8P0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.41
Tubgcp6G5E8P0 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Tubgcp6G5E8P0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Tubgcp6G5E8P0 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Tubgcp6G5E8P0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Tubgcp6G5E8P0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Tubgcp6G5E8P0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Tubgcp6G5E8P0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Tubgcp6G5E8P0 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Tubgcp6G5E8P0 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Tubgcp6G5E8P0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Tubgcp6G5E8P0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Tubgcp6G5E8P0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Tubgcp6G5E8P0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Tubgcp6G5E8P0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Tubgcp6G5E8P0 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
Tubgcp6G5E8P0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Tubgcp6G5E8P0 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Tubgcp6G5E8P0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Tubgcp6G5E8P0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Tubgcp6G5E8P0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Tubgcp6G5E8P0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Tubgcp6G5E8P0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Tubgcp6G5E8P0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Tubgcp6G5E8P0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Tubgcp6G5E8P0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Tubgcp6G5E8P0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Tubgcp6G5E8P0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Tubgcp6G5E8P0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Tubgcp6G5E8P0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Tubgcp6G5E8P0 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Tubgcp6G5E8P0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.41
Tubgcp6G5E8P0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Tubgcp6G5E8P0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Tubgcp6G5E8P0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms