Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9P8

Rdh16f1, RDH16 family member 1, mousemouse

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Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f1E9Q9P8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rdh16f1E9Q9P8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rdh16f1E9Q9P8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Rdh16f1E9Q9P8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rdh16f1E9Q9P8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rdh16f1E9Q9P8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Rdh16f1E9Q9P8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rdh16f1E9Q9P8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rdh16f1E9Q9P8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rdh16f1E9Q9P8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rdh16f1E9Q9P8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rdh16f1E9Q9P8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rdh16f1E9Q9P8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rdh16f1E9Q9P8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rdh16f1E9Q9P8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rdh16f1E9Q9P8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rdh16f1E9Q9P8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rdh16f1E9Q9P8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rdh16f1E9Q9P8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rdh16f1E9Q9P8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rdh16f1E9Q9P8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rdh16f1E9Q9P8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rdh16f1E9Q9P8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rdh16f1E9Q9P8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rdh16f1E9Q9P8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rdh16f1E9Q9P8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Rdh16f1E9Q9P8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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Rdh16f1E9Q9P8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rdh16f1E9Q9P8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rdh16f1E9Q9P8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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Rdh16f1E9Q9P8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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Rdh16f1E9Q9P8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Rdh16f1E9Q9P8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Rdh16f1E9Q9P8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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Rdh16f1E9Q9P8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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Rdh16f1E9Q9P8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Rdh16f1E9Q9P8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
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Rdh16f1E9Q9P8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rdh16f1E9Q9P8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Rdh16f1E9Q9P8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rdh16f1E9Q9P8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rdh16f1E9Q9P8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rdh16f1E9Q9P8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rdh16f1E9Q9P8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rdh16f1E9Q9P8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rdh16f1E9Q9P8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rdh16f1E9Q9P8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rdh16f1E9Q9P8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rdh16f1E9Q9P8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rdh16f1E9Q9P8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rdh16f1E9Q9P8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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