Protein–RNA interactions for Protein: E9Q355

Catsperg1, Cation channel sperm-associated protein subunit gamma 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Catsperg1E9Q355 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Catsperg1E9Q355 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Catsperg1E9Q355 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Catsperg1E9Q355 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Catsperg1E9Q355 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Catsperg1E9Q355 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Catsperg1E9Q355 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Catsperg1E9Q355 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Catsperg1E9Q355 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Catsperg1E9Q355 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Catsperg1E9Q355 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Catsperg1E9Q355 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Catsperg1E9Q355 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Catsperg1E9Q355 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Catsperg1E9Q355 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Catsperg1E9Q355 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Catsperg1E9Q355 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Catsperg1E9Q355 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Catsperg1E9Q355 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Catsperg1E9Q355 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Catsperg1E9Q355 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Catsperg1E9Q355 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Catsperg1E9Q355 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Catsperg1E9Q355 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Catsperg1E9Q355 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Catsperg1E9Q355 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Catsperg1E9Q355 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Catsperg1E9Q355 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Catsperg1E9Q355 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Catsperg1E9Q355 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Catsperg1E9Q355 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Catsperg1E9Q355 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Catsperg1E9Q355 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Catsperg1E9Q355 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Catsperg1E9Q355 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Catsperg1E9Q355 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Catsperg1E9Q355 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Catsperg1E9Q355 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Catsperg1E9Q355 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Catsperg1E9Q355 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Catsperg1E9Q355 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Catsperg1E9Q355 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Catsperg1E9Q355 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Catsperg1E9Q355 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Catsperg1E9Q355 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Catsperg1E9Q355 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Catsperg1E9Q355 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Catsperg1E9Q355 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Catsperg1E9Q355 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Catsperg1E9Q355 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Catsperg1E9Q355 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Catsperg1E9Q355 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Catsperg1E9Q355 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Catsperg1E9Q355 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Catsperg1E9Q355 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Catsperg1E9Q355 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Catsperg1E9Q355 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Catsperg1E9Q355 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Catsperg1E9Q355 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Catsperg1E9Q355 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Catsperg1E9Q355 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Catsperg1E9Q355 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Catsperg1E9Q355 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Catsperg1E9Q355 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Catsperg1E9Q355 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Catsperg1E9Q355 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Catsperg1E9Q355 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Catsperg1E9Q355 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Catsperg1E9Q355 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Catsperg1E9Q355 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Catsperg1E9Q355 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Catsperg1E9Q355 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Catsperg1E9Q355 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Catsperg1E9Q355 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Catsperg1E9Q355 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Catsperg1E9Q355 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Catsperg1E9Q355 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Catsperg1E9Q355 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Catsperg1E9Q355 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Catsperg1E9Q355 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Catsperg1E9Q355 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Catsperg1E9Q355 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Catsperg1E9Q355 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Catsperg1E9Q355 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Catsperg1E9Q355 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Catsperg1E9Q355 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Catsperg1E9Q355 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Catsperg1E9Q355 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Catsperg1E9Q355 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Catsperg1E9Q355 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Catsperg1E9Q355 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Catsperg1E9Q355 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Catsperg1E9Q355 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Catsperg1E9Q355 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Catsperg1E9Q355 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Catsperg1E9Q355 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Catsperg1E9Q355 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Catsperg1E9Q355 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Catsperg1E9Q355 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Catsperg1E9Q355 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms