Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2E9

Krtap11-1, Keratin-associated protein 11-1, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap11-1E9Q2E9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Krtap11-1E9Q2E9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Krtap11-1E9Q2E9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Krtap11-1E9Q2E9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Krtap11-1E9Q2E9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Krtap11-1E9Q2E9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Krtap11-1E9Q2E9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Krtap11-1E9Q2E9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Krtap11-1E9Q2E9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Krtap11-1E9Q2E9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Krtap11-1E9Q2E9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Krtap11-1E9Q2E9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Krtap11-1E9Q2E9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Krtap11-1E9Q2E9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Krtap11-1E9Q2E9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Krtap11-1E9Q2E9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Krtap11-1E9Q2E9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Krtap11-1E9Q2E9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Krtap11-1E9Q2E9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Krtap11-1E9Q2E9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Krtap11-1E9Q2E9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Krtap11-1E9Q2E9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Krtap11-1E9Q2E9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Krtap11-1E9Q2E9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Krtap11-1E9Q2E9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Krtap11-1E9Q2E9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Krtap11-1E9Q2E9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Krtap11-1E9Q2E9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Krtap11-1E9Q2E9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Krtap11-1E9Q2E9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Krtap11-1E9Q2E9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Krtap11-1E9Q2E9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Krtap11-1E9Q2E9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Krtap11-1E9Q2E9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Krtap11-1E9Q2E9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Krtap11-1E9Q2E9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Krtap11-1E9Q2E9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Krtap11-1E9Q2E9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Krtap11-1E9Q2E9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Krtap11-1E9Q2E9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Krtap11-1E9Q2E9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Krtap11-1E9Q2E9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Krtap11-1E9Q2E9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Krtap11-1E9Q2E9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Krtap11-1E9Q2E9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Krtap11-1E9Q2E9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Krtap11-1E9Q2E9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Krtap11-1E9Q2E9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Krtap11-1E9Q2E9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Krtap11-1E9Q2E9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Krtap11-1E9Q2E9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Krtap11-1E9Q2E9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Krtap11-1E9Q2E9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Krtap11-1E9Q2E9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Krtap11-1E9Q2E9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Krtap11-1E9Q2E9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Krtap11-1E9Q2E9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Krtap11-1E9Q2E9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Krtap11-1E9Q2E9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Krtap11-1E9Q2E9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Krtap11-1E9Q2E9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Krtap11-1E9Q2E9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Krtap11-1E9Q2E9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Krtap11-1E9Q2E9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Krtap11-1E9Q2E9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Krtap11-1E9Q2E9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Krtap11-1E9Q2E9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Krtap11-1E9Q2E9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Krtap11-1E9Q2E9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Krtap11-1E9Q2E9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Krtap11-1E9Q2E9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Krtap11-1E9Q2E9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Krtap11-1E9Q2E9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Krtap11-1E9Q2E9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Krtap11-1E9Q2E9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Krtap11-1E9Q2E9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Krtap11-1E9Q2E9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Krtap11-1E9Q2E9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Krtap11-1E9Q2E9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Krtap11-1E9Q2E9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Krtap11-1E9Q2E9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Krtap11-1E9Q2E9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Krtap11-1E9Q2E9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Krtap11-1E9Q2E9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Krtap11-1E9Q2E9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Krtap11-1E9Q2E9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Krtap11-1E9Q2E9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Krtap11-1E9Q2E9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Krtap11-1E9Q2E9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Krtap11-1E9Q2E9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Krtap11-1E9Q2E9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Krtap11-1E9Q2E9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Krtap11-1E9Q2E9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Krtap11-1E9Q2E9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Krtap11-1E9Q2E9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Krtap11-1E9Q2E9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Krtap11-1E9Q2E9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Krtap11-1E9Q2E9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Krtap11-1E9Q2E9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Krtap11-1E9Q2E9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms