Protein–RNA interactions for Protein: E9Q053

Gm9972, Predicted gene 9972, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9972E9Q053 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm9972E9Q053 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm9972E9Q053 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm9972E9Q053 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm9972E9Q053 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm9972E9Q053 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm9972E9Q053 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm9972E9Q053 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm9972E9Q053 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm9972E9Q053 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm9972E9Q053 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm9972E9Q053 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm9972E9Q053 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm9972E9Q053 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm9972E9Q053 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm9972E9Q053 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm9972E9Q053 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm9972E9Q053 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm9972E9Q053 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm9972E9Q053 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm9972E9Q053 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm9972E9Q053 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm9972E9Q053 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm9972E9Q053 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm9972E9Q053 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm9972E9Q053 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm9972E9Q053 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm9972E9Q053 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm9972E9Q053 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm9972E9Q053 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm9972E9Q053 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm9972E9Q053 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm9972E9Q053 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm9972E9Q053 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm9972E9Q053 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm9972E9Q053 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm9972E9Q053 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm9972E9Q053 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm9972E9Q053 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm9972E9Q053 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm9972E9Q053 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm9972E9Q053 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm9972E9Q053 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm9972E9Q053 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm9972E9Q053 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm9972E9Q053 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm9972E9Q053 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm9972E9Q053 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm9972E9Q053 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm9972E9Q053 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm9972E9Q053 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm9972E9Q053 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm9972E9Q053 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm9972E9Q053 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm9972E9Q053 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm9972E9Q053 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm9972E9Q053 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm9972E9Q053 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gm9972E9Q053 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gm9972E9Q053 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gm9972E9Q053 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm9972E9Q053 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm9972E9Q053 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm9972E9Q053 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm9972E9Q053 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm9972E9Q053 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm9972E9Q053 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm9972E9Q053 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm9972E9Q053 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm9972E9Q053 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm9972E9Q053 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm9972E9Q053 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm9972E9Q053 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm9972E9Q053 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm9972E9Q053 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm9972E9Q053 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm9972E9Q053 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm9972E9Q053 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm9972E9Q053 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm9972E9Q053 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm9972E9Q053 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm9972E9Q053 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm9972E9Q053 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm9972E9Q053 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm9972E9Q053 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm9972E9Q053 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm9972E9Q053 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm9972E9Q053 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm9972E9Q053 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm9972E9Q053 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm9972E9Q053 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm9972E9Q053 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm9972E9Q053 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm9972E9Q053 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm9972E9Q053 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm9972E9Q053 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm9972E9Q053 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm9972E9Q053 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm9972E9Q053 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm9972E9Q053 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 171.3 ms