Protein–RNA interactions for Protein: B2RXQ2

Ppfia1, Ppfia1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia1B2RXQ2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ppfia1B2RXQ2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Ppfia1B2RXQ2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Ppfia1B2RXQ2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ppfia1B2RXQ2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ppfia1B2RXQ2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ppfia1B2RXQ2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ppfia1B2RXQ2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ppfia1B2RXQ2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ppfia1B2RXQ2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Ppfia1B2RXQ2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ppfia1B2RXQ2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ppfia1B2RXQ2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ppfia1B2RXQ2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Ppfia1B2RXQ2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ppfia1B2RXQ2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ppfia1B2RXQ2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ppfia1B2RXQ2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ppfia1B2RXQ2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ppfia1B2RXQ2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ppfia1B2RXQ2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ppfia1B2RXQ2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Ppfia1B2RXQ2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ppfia1B2RXQ2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ppfia1B2RXQ2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ppfia1B2RXQ2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ppfia1B2RXQ2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ppfia1B2RXQ2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Ppfia1B2RXQ2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ppfia1B2RXQ2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ppfia1B2RXQ2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ppfia1B2RXQ2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ppfia1B2RXQ2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ppfia1B2RXQ2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ppfia1B2RXQ2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ppfia1B2RXQ2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ppfia1B2RXQ2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ppfia1B2RXQ2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ppfia1B2RXQ2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ppfia1B2RXQ2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Ppfia1B2RXQ2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ppfia1B2RXQ2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ppfia1B2RXQ2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ppfia1B2RXQ2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Ppfia1B2RXQ2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ppfia1B2RXQ2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Ppfia1B2RXQ2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ppfia1B2RXQ2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ppfia1B2RXQ2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ppfia1B2RXQ2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ppfia1B2RXQ2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ppfia1B2RXQ2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ppfia1B2RXQ2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ppfia1B2RXQ2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ppfia1B2RXQ2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ppfia1B2RXQ2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ppfia1B2RXQ2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ppfia1B2RXQ2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ppfia1B2RXQ2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ppfia1B2RXQ2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ppfia1B2RXQ2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ppfia1B2RXQ2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ppfia1B2RXQ2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ppfia1B2RXQ2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ppfia1B2RXQ2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ppfia1B2RXQ2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ppfia1B2RXQ2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ppfia1B2RXQ2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Ppfia1B2RXQ2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ppfia1B2RXQ2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ppfia1B2RXQ2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Ppfia1B2RXQ2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ppfia1B2RXQ2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ppfia1B2RXQ2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ppfia1B2RXQ2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ppfia1B2RXQ2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ppfia1B2RXQ2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ppfia1B2RXQ2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ppfia1B2RXQ2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ppfia1B2RXQ2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ppfia1B2RXQ2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ppfia1B2RXQ2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ppfia1B2RXQ2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ppfia1B2RXQ2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ppfia1B2RXQ2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ppfia1B2RXQ2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ppfia1B2RXQ2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ppfia1B2RXQ2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ppfia1B2RXQ2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ppfia1B2RXQ2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ppfia1B2RXQ2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ppfia1B2RXQ2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ppfia1B2RXQ2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ppfia1B2RXQ2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ppfia1B2RXQ2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ppfia1B2RXQ2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ppfia1B2RXQ2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ppfia1B2RXQ2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ppfia1B2RXQ2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ppfia1B2RXQ2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms