Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cspp1B2RX88 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cspp1B2RX88 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cspp1B2RX88 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cspp1B2RX88 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cspp1B2RX88 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cspp1B2RX88 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cspp1B2RX88 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cspp1B2RX88 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cspp1B2RX88 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Cspp1B2RX88 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cspp1B2RX88 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cspp1B2RX88 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cspp1B2RX88 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cspp1B2RX88 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cspp1B2RX88 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cspp1B2RX88 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cspp1B2RX88 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cspp1B2RX88 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cspp1B2RX88 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cspp1B2RX88 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cspp1B2RX88 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cspp1B2RX88 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cspp1B2RX88 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cspp1B2RX88 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cspp1B2RX88 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cspp1B2RX88 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cspp1B2RX88 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cspp1B2RX88 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cspp1B2RX88 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cspp1B2RX88 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cspp1B2RX88 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cspp1B2RX88 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cspp1B2RX88 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cspp1B2RX88 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cspp1B2RX88 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cspp1B2RX88 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cspp1B2RX88 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cspp1B2RX88 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cspp1B2RX88 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cspp1B2RX88 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cspp1B2RX88 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cspp1B2RX88 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cspp1B2RX88 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cspp1B2RX88 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cspp1B2RX88 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cspp1B2RX88 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cspp1B2RX88 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cspp1B2RX88 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cspp1B2RX88 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cspp1B2RX88 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cspp1B2RX88 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Cspp1B2RX88 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cspp1B2RX88 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cspp1B2RX88 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cspp1B2RX88 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cspp1B2RX88 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cspp1B2RX88 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cspp1B2RX88 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cspp1B2RX88 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cspp1B2RX88 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cspp1B2RX88 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cspp1B2RX88 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cspp1B2RX88 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cspp1B2RX88 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cspp1B2RX88 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cspp1B2RX88 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cspp1B2RX88 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cspp1B2RX88 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cspp1B2RX88 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cspp1B2RX88 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cspp1B2RX88 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cspp1B2RX88 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cspp1B2RX88 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cspp1B2RX88 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cspp1B2RX88 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cspp1B2RX88 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cspp1B2RX88 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cspp1B2RX88 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cspp1B2RX88 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cspp1B2RX88 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Cspp1B2RX88 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cspp1B2RX88 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Cspp1B2RX88 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cspp1B2RX88 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cspp1B2RX88 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cspp1B2RX88 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cspp1B2RX88 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Cspp1B2RX88 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cspp1B2RX88 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cspp1B2RX88 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cspp1B2RX88 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cspp1B2RX88 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Cspp1B2RX88 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cspp1B2RX88 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cspp1B2RX88 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cspp1B2RX88 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Cspp1B2RX88 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cspp1B2RX88 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cspp1B2RX88 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms