Protein–RNA interactions for Protein: B0QZW4

Supt3, Suppressor of Ty 3 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt3B0QZW4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Supt3B0QZW4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Supt3B0QZW4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Supt3B0QZW4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Supt3B0QZW4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Supt3B0QZW4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Supt3B0QZW4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Supt3B0QZW4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Supt3B0QZW4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Supt3B0QZW4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Supt3B0QZW4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Supt3B0QZW4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Supt3B0QZW4 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Supt3B0QZW4 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Supt3B0QZW4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Supt3B0QZW4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Supt3B0QZW4 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Supt3B0QZW4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Supt3B0QZW4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Supt3B0QZW4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Supt3B0QZW4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Supt3B0QZW4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Supt3B0QZW4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Supt3B0QZW4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Supt3B0QZW4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Supt3B0QZW4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Supt3B0QZW4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Supt3B0QZW4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Supt3B0QZW4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Supt3B0QZW4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Supt3B0QZW4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Supt3B0QZW4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Supt3B0QZW4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Supt3B0QZW4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Supt3B0QZW4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Supt3B0QZW4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Supt3B0QZW4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Supt3B0QZW4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Supt3B0QZW4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Supt3B0QZW4 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Supt3B0QZW4 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Supt3B0QZW4 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Supt3B0QZW4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Supt3B0QZW4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Supt3B0QZW4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Supt3B0QZW4 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Supt3B0QZW4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Supt3B0QZW4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Supt3B0QZW4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Supt3B0QZW4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Supt3B0QZW4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Supt3B0QZW4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Supt3B0QZW4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Supt3B0QZW4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Supt3B0QZW4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Supt3B0QZW4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Supt3B0QZW4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Supt3B0QZW4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Supt3B0QZW4 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Supt3B0QZW4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Supt3B0QZW4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Supt3B0QZW4 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Supt3B0QZW4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Supt3B0QZW4 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Supt3B0QZW4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Supt3B0QZW4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Supt3B0QZW4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Supt3B0QZW4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Supt3B0QZW4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Supt3B0QZW4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Supt3B0QZW4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Supt3B0QZW4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Supt3B0QZW4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Supt3B0QZW4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Supt3B0QZW4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Supt3B0QZW4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Supt3B0QZW4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Supt3B0QZW4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Supt3B0QZW4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Supt3B0QZW4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Supt3B0QZW4 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Supt3B0QZW4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Supt3B0QZW4 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Supt3B0QZW4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Supt3B0QZW4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Supt3B0QZW4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Supt3B0QZW4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Supt3B0QZW4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Supt3B0QZW4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Supt3B0QZW4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Supt3B0QZW4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Supt3B0QZW4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Supt3B0QZW4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Supt3B0QZW4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Supt3B0QZW4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Supt3B0QZW4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Supt3B0QZW4 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Supt3B0QZW4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Supt3B0QZW4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Supt3B0QZW4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms