Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samt1A2BED8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samt1A2BED8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Samt1A2BED8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Samt1A2BED8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Samt1A2BED8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Samt1A2BED8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Samt1A2BED8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Samt1A2BED8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Samt1A2BED8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Samt1A2BED8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Samt1A2BED8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Samt1A2BED8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Samt1A2BED8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Samt1A2BED8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Samt1A2BED8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Samt1A2BED8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Samt1A2BED8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Samt1A2BED8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Samt1A2BED8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Samt1A2BED8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Samt1A2BED8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Samt1A2BED8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Samt1A2BED8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Samt1A2BED8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Samt1A2BED8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samt1A2BED8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samt1A2BED8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samt1A2BED8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samt1A2BED8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samt1A2BED8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samt1A2BED8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Samt1A2BED8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Samt1A2BED8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Samt1A2BED8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Samt1A2BED8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Samt1A2BED8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Samt1A2BED8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Samt1A2BED8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Samt1A2BED8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Samt1A2BED8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Samt1A2BED8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Samt1A2BED8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Samt1A2BED8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Samt1A2BED8 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Samt1A2BED8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Samt1A2BED8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Samt1A2BED8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Samt1A2BED8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Samt1A2BED8 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Samt1A2BED8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Samt1A2BED8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Samt1A2BED8 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Samt1A2BED8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Samt1A2BED8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Samt1A2BED8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Samt1A2BED8 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Samt1A2BED8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Samt1A2BED8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Samt1A2BED8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Samt1A2BED8 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Samt1A2BED8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Samt1A2BED8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Samt1A2BED8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Samt1A2BED8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Samt1A2BED8 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Samt1A2BED8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Samt1A2BED8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Samt1A2BED8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Samt1A2BED8 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Samt1A2BED8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Samt1A2BED8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Samt1A2BED8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Samt1A2BED8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Samt1A2BED8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Samt1A2BED8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Samt1A2BED8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Samt1A2BED8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Samt1A2BED8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Samt1A2BED8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Samt1A2BED8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Samt1A2BED8 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Samt1A2BED8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Samt1A2BED8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Samt1A2BED8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Samt1A2BED8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Samt1A2BED8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Samt1A2BED8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Samt1A2BED8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Samt1A2BED8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Samt1A2BED8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Samt1A2BED8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Samt1A2BED8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Samt1A2BED8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Samt1A2BED8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Samt1A2BED8 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Samt1A2BED8 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Samt1A2BED8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Samt1A2BED8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Samt1A2BED8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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