Protein–RNA interactions for Protein: A2AFH1

Ube2dnl1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2D N-terminal-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2dnl1A2AFH1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ube2dnl1A2AFH1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ube2dnl1A2AFH1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ube2dnl1A2AFH1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ube2dnl1A2AFH1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ube2dnl1A2AFH1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ube2dnl1A2AFH1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ube2dnl1A2AFH1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ube2dnl1A2AFH1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ube2dnl1A2AFH1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ube2dnl1A2AFH1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ube2dnl1A2AFH1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ube2dnl1A2AFH1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ube2dnl1A2AFH1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ube2dnl1A2AFH1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ube2dnl1A2AFH1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ube2dnl1A2AFH1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ube2dnl1A2AFH1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ube2dnl1A2AFH1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ube2dnl1A2AFH1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ube2dnl1A2AFH1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ube2dnl1A2AFH1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ube2dnl1A2AFH1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ube2dnl1A2AFH1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ube2dnl1A2AFH1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ube2dnl1A2AFH1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ube2dnl1A2AFH1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ube2dnl1A2AFH1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ube2dnl1A2AFH1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ube2dnl1A2AFH1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ube2dnl1A2AFH1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ube2dnl1A2AFH1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ube2dnl1A2AFH1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Ube2dnl1A2AFH1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ube2dnl1A2AFH1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ube2dnl1A2AFH1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ube2dnl1A2AFH1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ube2dnl1A2AFH1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ube2dnl1A2AFH1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ube2dnl1A2AFH1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ube2dnl1A2AFH1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ube2dnl1A2AFH1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ube2dnl1A2AFH1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ube2dnl1A2AFH1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ube2dnl1A2AFH1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ube2dnl1A2AFH1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ube2dnl1A2AFH1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ube2dnl1A2AFH1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ube2dnl1A2AFH1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ube2dnl1A2AFH1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ube2dnl1A2AFH1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ube2dnl1A2AFH1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ube2dnl1A2AFH1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ube2dnl1A2AFH1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ube2dnl1A2AFH1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ube2dnl1A2AFH1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ube2dnl1A2AFH1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ube2dnl1A2AFH1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ube2dnl1A2AFH1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ube2dnl1A2AFH1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ube2dnl1A2AFH1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ube2dnl1A2AFH1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ube2dnl1A2AFH1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ube2dnl1A2AFH1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ube2dnl1A2AFH1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ube2dnl1A2AFH1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ube2dnl1A2AFH1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ube2dnl1A2AFH1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ube2dnl1A2AFH1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ube2dnl1A2AFH1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ube2dnl1A2AFH1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ube2dnl1A2AFH1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ube2dnl1A2AFH1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ube2dnl1A2AFH1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ube2dnl1A2AFH1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ube2dnl1A2AFH1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ube2dnl1A2AFH1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ube2dnl1A2AFH1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ube2dnl1A2AFH1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ube2dnl1A2AFH1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ube2dnl1A2AFH1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ube2dnl1A2AFH1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ube2dnl1A2AFH1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ube2dnl1A2AFH1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ube2dnl1A2AFH1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ube2dnl1A2AFH1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ube2dnl1A2AFH1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ube2dnl1A2AFH1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ube2dnl1A2AFH1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ube2dnl1A2AFH1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ube2dnl1A2AFH1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ube2dnl1A2AFH1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ube2dnl1A2AFH1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ube2dnl1A2AFH1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ube2dnl1A2AFH1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ube2dnl1A2AFH1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ube2dnl1A2AFH1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ube2dnl1A2AFH1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ube2dnl1A2AFH1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ube2dnl1A2AFH1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms