Protein–RNA interactions for Protein: A2AAY5

Sh3pxd2b, SH3 and PX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3pxd2bA2AAY5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sh3pxd2bA2AAY5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sh3pxd2bA2AAY5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sh3pxd2bA2AAY5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sh3pxd2bA2AAY5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sh3pxd2bA2AAY5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Sh3pxd2bA2AAY5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sh3pxd2bA2AAY5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sh3pxd2bA2AAY5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sh3pxd2bA2AAY5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sh3pxd2bA2AAY5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sh3pxd2bA2AAY5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sh3pxd2bA2AAY5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sh3pxd2bA2AAY5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sh3pxd2bA2AAY5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sh3pxd2bA2AAY5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sh3pxd2bA2AAY5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sh3pxd2bA2AAY5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sh3pxd2bA2AAY5 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sh3pxd2bA2AAY5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sh3pxd2bA2AAY5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sh3pxd2bA2AAY5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sh3pxd2bA2AAY5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sh3pxd2bA2AAY5 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sh3pxd2bA2AAY5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sh3pxd2bA2AAY5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sh3pxd2bA2AAY5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sh3pxd2bA2AAY5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sh3pxd2bA2AAY5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sh3pxd2bA2AAY5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sh3pxd2bA2AAY5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sh3pxd2bA2AAY5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sh3pxd2bA2AAY5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Sh3pxd2bA2AAY5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sh3pxd2bA2AAY5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sh3pxd2bA2AAY5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sh3pxd2bA2AAY5 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Sh3pxd2bA2AAY5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sh3pxd2bA2AAY5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sh3pxd2bA2AAY5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sh3pxd2bA2AAY5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sh3pxd2bA2AAY5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sh3pxd2bA2AAY5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sh3pxd2bA2AAY5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sh3pxd2bA2AAY5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sh3pxd2bA2AAY5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sh3pxd2bA2AAY5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sh3pxd2bA2AAY5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sh3pxd2bA2AAY5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh3pxd2bA2AAY5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh3pxd2bA2AAY5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh3pxd2bA2AAY5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh3pxd2bA2AAY5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh3pxd2bA2AAY5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh3pxd2bA2AAY5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh3pxd2bA2AAY5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh3pxd2bA2AAY5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh3pxd2bA2AAY5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh3pxd2bA2AAY5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh3pxd2bA2AAY5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh3pxd2bA2AAY5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh3pxd2bA2AAY5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh3pxd2bA2AAY5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh3pxd2bA2AAY5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh3pxd2bA2AAY5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh3pxd2bA2AAY5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh3pxd2bA2AAY5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh3pxd2bA2AAY5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh3pxd2bA2AAY5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh3pxd2bA2AAY5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh3pxd2bA2AAY5 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh3pxd2bA2AAY5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh3pxd2bA2AAY5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh3pxd2bA2AAY5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh3pxd2bA2AAY5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh3pxd2bA2AAY5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh3pxd2bA2AAY5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sh3pxd2bA2AAY5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sh3pxd2bA2AAY5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sh3pxd2bA2AAY5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sh3pxd2bA2AAY5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sh3pxd2bA2AAY5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sh3pxd2bA2AAY5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sh3pxd2bA2AAY5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sh3pxd2bA2AAY5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sh3pxd2bA2AAY5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sh3pxd2bA2AAY5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sh3pxd2bA2AAY5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sh3pxd2bA2AAY5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sh3pxd2bA2AAY5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sh3pxd2bA2AAY5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sh3pxd2bA2AAY5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sh3pxd2bA2AAY5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sh3pxd2bA2AAY5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sh3pxd2bA2AAY5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sh3pxd2bA2AAY5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Sh3pxd2bA2AAY5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sh3pxd2bA2AAY5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sh3pxd2bA2AAY5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Sh3pxd2bA2AAY5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms