Protein–RNA interactions for Protein: A1L317

Krt24, Keratin, type I cytoskeletal 24, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt24A1L317 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Krt24A1L317 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Krt24A1L317 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Krt24A1L317 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Krt24A1L317 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Krt24A1L317 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Krt24A1L317 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Krt24A1L317 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Krt24A1L317 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Krt24A1L317 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Krt24A1L317 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Krt24A1L317 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Krt24A1L317 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Krt24A1L317 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Krt24A1L317 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Krt24A1L317 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Krt24A1L317 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Krt24A1L317 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Krt24A1L317 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Krt24A1L317 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Krt24A1L317 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Krt24A1L317 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Krt24A1L317 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Krt24A1L317 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Krt24A1L317 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Krt24A1L317 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Krt24A1L317 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Krt24A1L317 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Krt24A1L317 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Krt24A1L317 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Krt24A1L317 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Krt24A1L317 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Krt24A1L317 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Krt24A1L317 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Krt24A1L317 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Krt24A1L317 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Krt24A1L317 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Krt24A1L317 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Krt24A1L317 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Krt24A1L317 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Krt24A1L317 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Krt24A1L317 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Krt24A1L317 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Krt24A1L317 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Krt24A1L317 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Krt24A1L317 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Krt24A1L317 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Krt24A1L317 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Krt24A1L317 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Krt24A1L317 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Krt24A1L317 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Krt24A1L317 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Krt24A1L317 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Krt24A1L317 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Krt24A1L317 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Krt24A1L317 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Krt24A1L317 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Krt24A1L317 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Krt24A1L317 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Krt24A1L317 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Krt24A1L317 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Krt24A1L317 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Krt24A1L317 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Krt24A1L317 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Krt24A1L317 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Krt24A1L317 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Krt24A1L317 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Krt24A1L317 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Krt24A1L317 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Krt24A1L317 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Krt24A1L317 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Krt24A1L317 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Krt24A1L317 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Krt24A1L317 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Krt24A1L317 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Krt24A1L317 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Krt24A1L317 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Krt24A1L317 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Krt24A1L317 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Krt24A1L317 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Krt24A1L317 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Krt24A1L317 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Krt24A1L317 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Krt24A1L317 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Krt24A1L317 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Krt24A1L317 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Krt24A1L317 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Krt24A1L317 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Krt24A1L317 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Krt24A1L317 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Krt24A1L317 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Krt24A1L317 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Krt24A1L317 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Krt24A1L317 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Krt24A1L317 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Krt24A1L317 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Krt24A1L317 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Krt24A1L317 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Krt24A1L317 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Krt24A1L317 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms