Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5W3

Ighv1-53, Immunoglobulin heavy variable 1-53 (Fragment), mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv1-53A0A075B5W3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ighv1-53A0A075B5W3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ighv1-53A0A075B5W3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ighv1-53A0A075B5W3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ighv1-53A0A075B5W3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ighv1-53A0A075B5W3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ighv1-53A0A075B5W3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ighv1-53A0A075B5W3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ighv1-53A0A075B5W3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ighv1-53A0A075B5W3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ighv1-53A0A075B5W3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ighv1-53A0A075B5W3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ighv1-53A0A075B5W3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ighv1-53A0A075B5W3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ighv1-53A0A075B5W3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ighv1-53A0A075B5W3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ighv1-53A0A075B5W3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ighv1-53A0A075B5W3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ighv1-53A0A075B5W3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ighv1-53A0A075B5W3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ighv1-53A0A075B5W3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ighv1-53A0A075B5W3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ighv1-53A0A075B5W3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ighv1-53A0A075B5W3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Ighv1-53A0A075B5W3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Ighv1-53A0A075B5W3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ighv1-53A0A075B5W3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ighv1-53A0A075B5W3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Ighv1-53A0A075B5W3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ighv1-53A0A075B5W3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Ighv1-53A0A075B5W3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ighv1-53A0A075B5W3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ighv1-53A0A075B5W3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Ighv1-53A0A075B5W3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Ighv1-53A0A075B5W3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ighv1-53A0A075B5W3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ighv1-53A0A075B5W3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ighv1-53A0A075B5W3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ighv1-53A0A075B5W3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ighv1-53A0A075B5W3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ighv1-53A0A075B5W3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Ighv1-53A0A075B5W3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ighv1-53A0A075B5W3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ighv1-53A0A075B5W3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ighv1-53A0A075B5W3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ighv1-53A0A075B5W3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ighv1-53A0A075B5W3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ighv1-53A0A075B5W3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ighv1-53A0A075B5W3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ighv1-53A0A075B5W3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ighv1-53A0A075B5W3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ighv1-53A0A075B5W3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Ighv1-53A0A075B5W3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Ighv1-53A0A075B5W3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ighv1-53A0A075B5W3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ighv1-53A0A075B5W3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ighv1-53A0A075B5W3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ighv1-53A0A075B5W3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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