Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP4

Serpinb6c, Serine (or cysteine) peptidase inhibitor, clade B, member 6C, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpinb6cW4VSP4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Serpinb6cW4VSP4 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Serpinb6cW4VSP4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Serpinb6cW4VSP4 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Serpinb6cW4VSP4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Serpinb6cW4VSP4 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Serpinb6cW4VSP4 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Serpinb6cW4VSP4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Serpinb6cW4VSP4 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Serpinb6cW4VSP4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Serpinb6cW4VSP4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Serpinb6cW4VSP4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Serpinb6cW4VSP4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Serpinb6cW4VSP4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Serpinb6cW4VSP4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Serpinb6cW4VSP4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Serpinb6cW4VSP4 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Serpinb6cW4VSP4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Serpinb6cW4VSP4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Serpinb6cW4VSP4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Serpinb6cW4VSP4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Serpinb6cW4VSP4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Serpinb6cW4VSP4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Serpinb6cW4VSP4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Serpinb6cW4VSP4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Serpinb6cW4VSP4 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Serpinb6cW4VSP4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Serpinb6cW4VSP4 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Serpinb6cW4VSP4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Serpinb6cW4VSP4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Serpinb6cW4VSP4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Serpinb6cW4VSP4 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Serpinb6cW4VSP4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Serpinb6cW4VSP4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Serpinb6cW4VSP4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Serpinb6cW4VSP4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Serpinb6cW4VSP4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Serpinb6cW4VSP4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Serpinb6cW4VSP4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Serpinb6cW4VSP4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Serpinb6cW4VSP4 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Serpinb6cW4VSP4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Serpinb6cW4VSP4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Serpinb6cW4VSP4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Serpinb6cW4VSP4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Serpinb6cW4VSP4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
Serpinb6cW4VSP4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Serpinb6cW4VSP4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Serpinb6cW4VSP4 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Serpinb6cW4VSP4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Serpinb6cW4VSP4 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Serpinb6cW4VSP4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Serpinb6cW4VSP4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Serpinb6cW4VSP4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Serpinb6cW4VSP4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Serpinb6cW4VSP4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Serpinb6cW4VSP4 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Serpinb6cW4VSP4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Serpinb6cW4VSP4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Serpinb6cW4VSP4 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Serpinb6cW4VSP4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Serpinb6cW4VSP4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Serpinb6cW4VSP4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Serpinb6cW4VSP4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Serpinb6cW4VSP4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Serpinb6cW4VSP4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Serpinb6cW4VSP4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Serpinb6cW4VSP4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Serpinb6cW4VSP4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Serpinb6cW4VSP4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Serpinb6cW4VSP4 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Serpinb6cW4VSP4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Serpinb6cW4VSP4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Serpinb6cW4VSP4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Serpinb6cW4VSP4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
Serpinb6cW4VSP4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Serpinb6cW4VSP4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Serpinb6cW4VSP4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Serpinb6cW4VSP4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Serpinb6cW4VSP4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Serpinb6cW4VSP4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Serpinb6cW4VSP4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Serpinb6cW4VSP4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Serpinb6cW4VSP4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Serpinb6cW4VSP4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Serpinb6cW4VSP4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Serpinb6cW4VSP4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Serpinb6cW4VSP4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Serpinb6cW4VSP4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Serpinb6cW4VSP4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Serpinb6cW4VSP4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Serpinb6cW4VSP4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Serpinb6cW4VSP4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Serpinb6cW4VSP4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Serpinb6cW4VSP4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Serpinb6cW4VSP4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Serpinb6cW4VSP4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Serpinb6cW4VSP4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Serpinb6cW4VSP4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Serpinb6cW4VSP4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms