Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP2

Vmn2r25, MCG130582, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r25W4VSP2 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Vmn2r25W4VSP2 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Vmn2r25W4VSP2 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Vmn2r25W4VSP2 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Vmn2r25W4VSP2 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Vmn2r25W4VSP2 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Vmn2r25W4VSP2 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Vmn2r25W4VSP2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Vmn2r25W4VSP2 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Vmn2r25W4VSP2 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Vmn2r25W4VSP2 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Vmn2r25W4VSP2 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Vmn2r25W4VSP2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Vmn2r25W4VSP2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Vmn2r25W4VSP2 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Vmn2r25W4VSP2 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Vmn2r25W4VSP2 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Vmn2r25W4VSP2 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Vmn2r25W4VSP2 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Vmn2r25W4VSP2 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Vmn2r25W4VSP2 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Vmn2r25W4VSP2 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Vmn2r25W4VSP2 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Vmn2r25W4VSP2 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Vmn2r25W4VSP2 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Vmn2r25W4VSP2 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Vmn2r25W4VSP2 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Vmn2r25W4VSP2 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Vmn2r25W4VSP2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Vmn2r25W4VSP2 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Vmn2r25W4VSP2 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Vmn2r25W4VSP2 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Vmn2r25W4VSP2 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Vmn2r25W4VSP2 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Vmn2r25W4VSP2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Vmn2r25W4VSP2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Vmn2r25W4VSP2 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Vmn2r25W4VSP2 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Vmn2r25W4VSP2 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Vmn2r25W4VSP2 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Vmn2r25W4VSP2 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Vmn2r25W4VSP2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Vmn2r25W4VSP2 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Vmn2r25W4VSP2 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Vmn2r25W4VSP2 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Vmn2r25W4VSP2 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Vmn2r25W4VSP2 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Vmn2r25W4VSP2 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Vmn2r25W4VSP2 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Vmn2r25W4VSP2 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Vmn2r25W4VSP2 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Vmn2r25W4VSP2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Vmn2r25W4VSP2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Vmn2r25W4VSP2 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Vmn2r25W4VSP2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Vmn2r25W4VSP2 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Vmn2r25W4VSP2 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Vmn2r25W4VSP2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Vmn2r25W4VSP2 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Vmn2r25W4VSP2 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Vmn2r25W4VSP2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Vmn2r25W4VSP2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Vmn2r25W4VSP2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Vmn2r25W4VSP2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Vmn2r25W4VSP2 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Vmn2r25W4VSP2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Vmn2r25W4VSP2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Vmn2r25W4VSP2 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Vmn2r25W4VSP2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Vmn2r25W4VSP2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Vmn2r25W4VSP2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Vmn2r25W4VSP2 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Vmn2r25W4VSP2 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Vmn2r25W4VSP2 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Vmn2r25W4VSP2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Vmn2r25W4VSP2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Vmn2r25W4VSP2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Vmn2r25W4VSP2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Vmn2r25W4VSP2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Vmn2r25W4VSP2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Vmn2r25W4VSP2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Vmn2r25W4VSP2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Vmn2r25W4VSP2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Vmn2r25W4VSP2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Vmn2r25W4VSP2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Vmn2r25W4VSP2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Vmn2r25W4VSP2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Vmn2r25W4VSP2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Vmn2r25W4VSP2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Vmn2r25W4VSP2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Vmn2r25W4VSP2 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Vmn2r25W4VSP2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Vmn2r25W4VSP2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Vmn2r25W4VSP2 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Vmn2r25W4VSP2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Vmn2r25W4VSP2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Vmn2r25W4VSP2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Vmn2r25W4VSP2 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Vmn2r25W4VSP2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Vmn2r25W4VSP2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms