Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN8

Gm5114, MCG1026354, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5114W4VSN8 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Gm5114W4VSN8 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Gm5114W4VSN8 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Gm5114W4VSN8 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Gm5114W4VSN8 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Gm5114W4VSN8 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
Gm5114W4VSN8 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Gm5114W4VSN8 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Gm5114W4VSN8 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
Gm5114W4VSN8 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Gm5114W4VSN8 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Gm5114W4VSN8 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Gm5114W4VSN8 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
Gm5114W4VSN8 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
Gm5114W4VSN8 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Gm5114W4VSN8 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
Gm5114W4VSN8 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
Gm5114W4VSN8 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Gm5114W4VSN8 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Gm5114W4VSN8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
Gm5114W4VSN8 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Gm5114W4VSN8 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Gm5114W4VSN8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Gm5114W4VSN8 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Gm5114W4VSN8 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Gm5114W4VSN8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
Gm5114W4VSN8 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
Gm5114W4VSN8 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Gm5114W4VSN8 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Gm5114W4VSN8 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Gm5114W4VSN8 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Gm5114W4VSN8 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Gm5114W4VSN8 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Gm5114W4VSN8 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Gm5114W4VSN8 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Gm5114W4VSN8 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Gm5114W4VSN8 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Gm5114W4VSN8 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Gm5114W4VSN8 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Gm5114W4VSN8 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
Gm5114W4VSN8 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Gm5114W4VSN8 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
Gm5114W4VSN8 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Gm5114W4VSN8 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Gm5114W4VSN8 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Gm5114W4VSN8 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
Gm5114W4VSN8 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Gm5114W4VSN8 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Gm5114W4VSN8 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
Gm5114W4VSN8 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Gm5114W4VSN8 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Gm5114W4VSN8 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Gm5114W4VSN8 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Gm5114W4VSN8 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Gm5114W4VSN8 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Gm5114W4VSN8 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Gm5114W4VSN8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Gm5114W4VSN8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Gm5114W4VSN8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
Gm5114W4VSN8 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Gm5114W4VSN8 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Gm5114W4VSN8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Gm5114W4VSN8 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Gm5114W4VSN8 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Gm5114W4VSN8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
Gm5114W4VSN8 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Gm5114W4VSN8 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Gm5114W4VSN8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Gm5114W4VSN8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Gm5114W4VSN8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Gm5114W4VSN8 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Gm5114W4VSN8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Gm5114W4VSN8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Gm5114W4VSN8 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Gm5114W4VSN8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
Gm5114W4VSN8 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Gm5114W4VSN8 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Gm5114W4VSN8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Gm5114W4VSN8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
Gm5114W4VSN8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Gm5114W4VSN8 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Gm5114W4VSN8 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Gm5114W4VSN8 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Gm5114W4VSN8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Gm5114W4VSN8 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Gm5114W4VSN8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Gm5114W4VSN8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Gm5114W4VSN8 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Gm5114W4VSN8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Gm5114W4VSN8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Gm5114W4VSN8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Gm5114W4VSN8 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Gm5114W4VSN8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Gm5114W4VSN8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Gm5114W4VSN8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Gm5114W4VSN8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
Gm5114W4VSN8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Gm5114W4VSN8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Gm5114W4VSN8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Gm5114W4VSN8 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms