Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z261

Cldn7, Claudin-7, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn7Q9Z261 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cldn7Q9Z261 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.53■■■□□ 2
Cldn7Q9Z261 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Cldn7Q9Z261 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cldn7Q9Z261 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cldn7Q9Z261 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Cldn7Q9Z261 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cldn7Q9Z261 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cldn7Q9Z261 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cldn7Q9Z261 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cldn7Q9Z261 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cldn7Q9Z261 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cldn7Q9Z261 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cldn7Q9Z261 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cldn7Q9Z261 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Cldn7Q9Z261 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cldn7Q9Z261 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cldn7Q9Z261 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cldn7Q9Z261 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cldn7Q9Z261 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cldn7Q9Z261 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cldn7Q9Z261 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cldn7Q9Z261 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cldn7Q9Z261 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cldn7Q9Z261 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cldn7Q9Z261 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cldn7Q9Z261 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cldn7Q9Z261 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cldn7Q9Z261 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cldn7Q9Z261 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cldn7Q9Z261 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cldn7Q9Z261 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cldn7Q9Z261 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cldn7Q9Z261 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Cldn7Q9Z261 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cldn7Q9Z261 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Cldn7Q9Z261 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Cldn7Q9Z261 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Cldn7Q9Z261 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cldn7Q9Z261 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Cldn7Q9Z261 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cldn7Q9Z261 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cldn7Q9Z261 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cldn7Q9Z261 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cldn7Q9Z261 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cldn7Q9Z261 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cldn7Q9Z261 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cldn7Q9Z261 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Cldn7Q9Z261 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cldn7Q9Z261 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cldn7Q9Z261 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cldn7Q9Z261 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cldn7Q9Z261 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cldn7Q9Z261 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Cldn7Q9Z261 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cldn7Q9Z261 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Cldn7Q9Z261 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cldn7Q9Z261 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cldn7Q9Z261 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cldn7Q9Z261 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cldn7Q9Z261 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cldn7Q9Z261 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cldn7Q9Z261 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cldn7Q9Z261 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cldn7Q9Z261 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cldn7Q9Z261 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cldn7Q9Z261 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cldn7Q9Z261 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cldn7Q9Z261 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cldn7Q9Z261 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cldn7Q9Z261 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cldn7Q9Z261 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Cldn7Q9Z261 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cldn7Q9Z261 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cldn7Q9Z261 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cldn7Q9Z261 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cldn7Q9Z261 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cldn7Q9Z261 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Cldn7Q9Z261 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cldn7Q9Z261 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cldn7Q9Z261 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cldn7Q9Z261 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cldn7Q9Z261 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cldn7Q9Z261 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cldn7Q9Z261 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cldn7Q9Z261 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cldn7Q9Z261 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cldn7Q9Z261 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cldn7Q9Z261 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cldn7Q9Z261 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cldn7Q9Z261 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cldn7Q9Z261 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cldn7Q9Z261 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cldn7Q9Z261 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cldn7Q9Z261 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Cldn7Q9Z261 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cldn7Q9Z261 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cldn7Q9Z261 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cldn7Q9Z261 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cldn7Q9Z261 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 142.1 ms