Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z238

Ccne2, G1/S-specific cyclin-E2, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne2Q9Z238 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,03■■■■□ 3,04
Ccne2Q9Z238 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC33,99■■■■□ 3,03
Ccne2Q9Z238 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,97■■■■□ 3,03
Ccne2Q9Z238 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33,96■■■■□ 3,03
Ccne2Q9Z238 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC33,96■■■■□ 3,03
Ccne2Q9Z238 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC33,95■■■■□ 3,03
Ccne2Q9Z238 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33,91■■■■□ 3,02
Ccne2Q9Z238 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,9■■■■□ 3,02
Ccne2Q9Z238 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC33,9■■■■□ 3,02
Ccne2Q9Z238 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC33,9■■■■□ 3,02
Ccne2Q9Z238 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC33,89■■■■□ 3,02
Ccne2Q9Z238 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC33,88■■■■□ 3,01
Ccne2Q9Z238 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,82■■■■□ 3
Ccne2Q9Z238 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC33,81■■■■□ 3
Ccne2Q9Z238 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,81■■■■□ 3
Ccne2Q9Z238 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC33,76■■■□□ 2,99
Ccne2Q9Z238 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,72■■■□□ 2,99
Ccne2Q9Z238 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC33,67■■■□□ 2,98
Ccne2Q9Z238 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,66■■■□□ 2,98
Ccne2Q9Z238 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,64■■■□□ 2,98
Ccne2Q9Z238 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC33,63■■■□□ 2,97
Ccne2Q9Z238 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,62■■■□□ 2,97
Ccne2Q9Z238 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,6■■■□□ 2,97
Ccne2Q9Z238 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,54■■■□□ 2,96
Ccne2Q9Z238 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33,5■■■□□ 2,95
Ccne2Q9Z238 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,47■■■□□ 2,95
Ccne2Q9Z238 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,47■■■□□ 2,95
Ccne2Q9Z238 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,46■■■□□ 2,95
Ccne2Q9Z238 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33,44■■■□□ 2,94
Ccne2Q9Z238 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33,42■■■□□ 2,94
Ccne2Q9Z238 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC33,39■■■□□ 2,94
Ccne2Q9Z238 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC33,37■■■□□ 2,93
Ccne2Q9Z238 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,32■■■□□ 2,92
Ccne2Q9Z238 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,31■■■□□ 2,92
Ccne2Q9Z238 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,28■■■□□ 2,92
Ccne2Q9Z238 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,21■■■□□ 2,91
Ccne2Q9Z238 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC33,19■■■□□ 2,9
Ccne2Q9Z238 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,16■■■□□ 2,9
Ccne2Q9Z238 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,16■■■□□ 2,9
Ccne2Q9Z238 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,14■■■□□ 2,9
Ccne2Q9Z238 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,12■■■□□ 2,89
Ccne2Q9Z238 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33,11■■■□□ 2,89
Ccne2Q9Z238 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC33,1■■■□□ 2,89
Ccne2Q9Z238 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC33,1■■■□□ 2,89
Ccne2Q9Z238 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC33,09■■■□□ 2,89
Ccne2Q9Z238 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,07■■■□□ 2,88
Ccne2Q9Z238 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC33,05■■■□□ 2,88
Ccne2Q9Z238 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC33,04■■■□□ 2,88
Ccne2Q9Z238 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,03■■■□□ 2,88
Ccne2Q9Z238 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,94■■■□□ 2,86
Ccne2Q9Z238 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC32,93■■■□□ 2,86
Ccne2Q9Z238 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,92■■■□□ 2,86
Ccne2Q9Z238 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC32,92■■■□□ 2,86
Ccne2Q9Z238 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC32,91■■■□□ 2,86
Ccne2Q9Z238 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC32,91■■■□□ 2,86
Ccne2Q9Z238 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,9■■■□□ 2,86
Ccne2Q9Z238 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC32,9■■■□□ 2,86
Ccne2Q9Z238 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,9■■■□□ 2,86
Ccne2Q9Z238 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,9■■■□□ 2,86
Ccne2Q9Z238 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC32,86■■■□□ 2,85
Ccne2Q9Z238 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC32,85■■■□□ 2,85
Ccne2Q9Z238 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC32,83■■■□□ 2,85
Ccne2Q9Z238 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC32,83■■■□□ 2,85
Ccne2Q9Z238 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC32,75■■■□□ 2,83
Ccne2Q9Z238 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC32,62■■■□□ 2,81
Ccne2Q9Z238 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32,55■■■□□ 2,8
Ccne2Q9Z238 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,54■■■□□ 2,8
Ccne2Q9Z238 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,51■■■□□ 2,79
Ccne2Q9Z238 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,51■■■□□ 2,79
Ccne2Q9Z238 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,5■■■□□ 2,79
Ccne2Q9Z238 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,5■■■□□ 2,79
Ccne2Q9Z238 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,5■■■□□ 2,79
Ccne2Q9Z238 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,49■■■□□ 2,79
Ccne2Q9Z238 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC32,49■■■□□ 2,79
Ccne2Q9Z238 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,47■■■□□ 2,79
Ccne2Q9Z238 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,45■■■□□ 2,79
Ccne2Q9Z238 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,45■■■□□ 2,78
Ccne2Q9Z238 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC32,44■■■□□ 2,78
Ccne2Q9Z238 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC32,43■■■□□ 2,78
Ccne2Q9Z238 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC32,42■■■□□ 2,78
Ccne2Q9Z238 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,42■■■□□ 2,78
Ccne2Q9Z238 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC32,41■■■□□ 2,78
Ccne2Q9Z238 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,38■■■□□ 2,77
Ccne2Q9Z238 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,36■■■□□ 2,77
Ccne2Q9Z238 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC32,35■■■□□ 2,77
Ccne2Q9Z238 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,35■■■□□ 2,77
Ccne2Q9Z238 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC32,34■■■□□ 2,77
Ccne2Q9Z238 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC32,32■■■□□ 2,76
Ccne2Q9Z238 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32,31■■■□□ 2,76
Ccne2Q9Z238 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC32,3■■■□□ 2,76
Ccne2Q9Z238 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC32,23■■■□□ 2,75
Ccne2Q9Z238 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,22■■■□□ 2,75
Ccne2Q9Z238 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,22■■■□□ 2,75
Ccne2Q9Z238 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,2■■■□□ 2,75
Ccne2Q9Z238 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC32,19■■■□□ 2,74
Ccne2Q9Z238 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32,17■■■□□ 2,74
Ccne2Q9Z238 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,15■■■□□ 2,74
Ccne2Q9Z238 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,14■■■□□ 2,74
Ccne2Q9Z238 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,13■■■□□ 2,73
Ccne2Q9Z238 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC32,12■■■□□ 2,73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13,6 ms