Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z238

Ccne2, G1/S-specific cyclin-E2, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne2Q9Z238 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Ccne2Q9Z238 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Ccne2Q9Z238 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Ccne2Q9Z238 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Ccne2Q9Z238 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Ccne2Q9Z238 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
Ccne2Q9Z238 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Ccne2Q9Z238 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Ccne2Q9Z238 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Ccne2Q9Z238 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Ccne2Q9Z238 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Ccne2Q9Z238 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Ccne2Q9Z238 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Ccne2Q9Z238 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC33.81■■■■□ 3
Ccne2Q9Z238 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Ccne2Q9Z238 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Ccne2Q9Z238 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Ccne2Q9Z238 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
Ccne2Q9Z238 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Ccne2Q9Z238 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Ccne2Q9Z238 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Ccne2Q9Z238 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Ccne2Q9Z238 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Ccne2Q9Z238 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Ccne2Q9Z238 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Ccne2Q9Z238 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Ccne2Q9Z238 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Ccne2Q9Z238 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Ccne2Q9Z238 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Ccne2Q9Z238 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Ccne2Q9Z238 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Ccne2Q9Z238 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
Ccne2Q9Z238 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Ccne2Q9Z238 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Ccne2Q9Z238 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Ccne2Q9Z238 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Ccne2Q9Z238 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Ccne2Q9Z238 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Ccne2Q9Z238 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Ccne2Q9Z238 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Ccne2Q9Z238 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Ccne2Q9Z238 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Ccne2Q9Z238 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Ccne2Q9Z238 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Ccne2Q9Z238 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
Ccne2Q9Z238 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Ccne2Q9Z238 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
Ccne2Q9Z238 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Ccne2Q9Z238 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Ccne2Q9Z238 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Ccne2Q9Z238 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Ccne2Q9Z238 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Ccne2Q9Z238 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
Ccne2Q9Z238 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Ccne2Q9Z238 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
Ccne2Q9Z238 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Ccne2Q9Z238 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Ccne2Q9Z238 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Ccne2Q9Z238 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Ccne2Q9Z238 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Ccne2Q9Z238 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Ccne2Q9Z238 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
Ccne2Q9Z238 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Ccne2Q9Z238 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Ccne2Q9Z238 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Ccne2Q9Z238 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Ccne2Q9Z238 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Ccne2Q9Z238 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Ccne2Q9Z238 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Ccne2Q9Z238 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Ccne2Q9Z238 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Ccne2Q9Z238 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Ccne2Q9Z238 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Ccne2Q9Z238 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Ccne2Q9Z238 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Ccne2Q9Z238 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Ccne2Q9Z238 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Ccne2Q9Z238 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Ccne2Q9Z238 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Ccne2Q9Z238 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Ccne2Q9Z238 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Ccne2Q9Z238 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
Ccne2Q9Z238 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Ccne2Q9Z238 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Ccne2Q9Z238 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Ccne2Q9Z238 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Ccne2Q9Z238 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Ccne2Q9Z238 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Ccne2Q9Z238 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Ccne2Q9Z238 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Ccne2Q9Z238 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Ccne2Q9Z238 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Ccne2Q9Z238 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Ccne2Q9Z238 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Ccne2Q9Z238 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Ccne2Q9Z238 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Ccne2Q9Z238 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Ccne2Q9Z238 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Ccne2Q9Z238 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Ccne2Q9Z238 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms