Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1W9

Stk39, STE20/SPS1-related proline-alanine-rich protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stk39Q9Z1W9 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Stk39Q9Z1W9 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Stk39Q9Z1W9 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Stk39Q9Z1W9 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Stk39Q9Z1W9 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Stk39Q9Z1W9 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Stk39Q9Z1W9 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Stk39Q9Z1W9 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Stk39Q9Z1W9 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
Stk39Q9Z1W9 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Stk39Q9Z1W9 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Stk39Q9Z1W9 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Stk39Q9Z1W9 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Stk39Q9Z1W9 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Stk39Q9Z1W9 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
Stk39Q9Z1W9 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
Stk39Q9Z1W9 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Stk39Q9Z1W9 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
Stk39Q9Z1W9 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Stk39Q9Z1W9 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC31.76■■■□□ 2.67
Stk39Q9Z1W9 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Stk39Q9Z1W9 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Stk39Q9Z1W9 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
Stk39Q9Z1W9 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
Stk39Q9Z1W9 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Stk39Q9Z1W9 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Stk39Q9Z1W9 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Stk39Q9Z1W9 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Stk39Q9Z1W9 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Stk39Q9Z1W9 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Stk39Q9Z1W9 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Stk39Q9Z1W9 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Stk39Q9Z1W9 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Stk39Q9Z1W9 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Stk39Q9Z1W9 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Stk39Q9Z1W9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Stk39Q9Z1W9 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
Stk39Q9Z1W9 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Stk39Q9Z1W9 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
Stk39Q9Z1W9 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Stk39Q9Z1W9 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
Stk39Q9Z1W9 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
Stk39Q9Z1W9 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Stk39Q9Z1W9 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Stk39Q9Z1W9 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Stk39Q9Z1W9 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Stk39Q9Z1W9 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Stk39Q9Z1W9 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Stk39Q9Z1W9 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Stk39Q9Z1W9 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Stk39Q9Z1W9 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Stk39Q9Z1W9 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Stk39Q9Z1W9 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Stk39Q9Z1W9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Stk39Q9Z1W9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Stk39Q9Z1W9 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Stk39Q9Z1W9 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Stk39Q9Z1W9 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Stk39Q9Z1W9 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
Stk39Q9Z1W9 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Stk39Q9Z1W9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC31■■■□□ 2.55
Stk39Q9Z1W9 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Stk39Q9Z1W9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Stk39Q9Z1W9 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Stk39Q9Z1W9 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Stk39Q9Z1W9 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Stk39Q9Z1W9 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Stk39Q9Z1W9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Stk39Q9Z1W9 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Stk39Q9Z1W9 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.53
Stk39Q9Z1W9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Stk39Q9Z1W9 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Stk39Q9Z1W9 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
Stk39Q9Z1W9 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Stk39Q9Z1W9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Stk39Q9Z1W9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Stk39Q9Z1W9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Stk39Q9Z1W9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Stk39Q9Z1W9 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Stk39Q9Z1W9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Stk39Q9Z1W9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
Stk39Q9Z1W9 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Stk39Q9Z1W9 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Stk39Q9Z1W9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
Stk39Q9Z1W9 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Stk39Q9Z1W9 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Stk39Q9Z1W9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
Stk39Q9Z1W9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Stk39Q9Z1W9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Stk39Q9Z1W9 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Stk39Q9Z1W9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Stk39Q9Z1W9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Stk39Q9Z1W9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Stk39Q9Z1W9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Stk39Q9Z1W9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
Stk39Q9Z1W9 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Stk39Q9Z1W9 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Stk39Q9Z1W9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Stk39Q9Z1W9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Stk39Q9Z1W9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms