Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L5

Cacna2d3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d3Q9Z1L5 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cacna2d3Q9Z1L5 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cacna2d3Q9Z1L5 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cacna2d3Q9Z1L5 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Cacna2d3Q9Z1L5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Cacna2d3Q9Z1L5 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cacna2d3Q9Z1L5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cacna2d3Q9Z1L5 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Cacna2d3Q9Z1L5 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Cacna2d3Q9Z1L5 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cacna2d3Q9Z1L5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cacna2d3Q9Z1L5 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cacna2d3Q9Z1L5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cacna2d3Q9Z1L5 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cacna2d3Q9Z1L5 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cacna2d3Q9Z1L5 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cacna2d3Q9Z1L5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Cacna2d3Q9Z1L5 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Cacna2d3Q9Z1L5 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cacna2d3Q9Z1L5 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cacna2d3Q9Z1L5 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cacna2d3Q9Z1L5 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cacna2d3Q9Z1L5 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cacna2d3Q9Z1L5 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Cacna2d3Q9Z1L5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Cacna2d3Q9Z1L5 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cacna2d3Q9Z1L5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cacna2d3Q9Z1L5 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cacna2d3Q9Z1L5 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cacna2d3Q9Z1L5 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cacna2d3Q9Z1L5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cacna2d3Q9Z1L5 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cacna2d3Q9Z1L5 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cacna2d3Q9Z1L5 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Cacna2d3Q9Z1L5 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cacna2d3Q9Z1L5 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cacna2d3Q9Z1L5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cacna2d3Q9Z1L5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cacna2d3Q9Z1L5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cacna2d3Q9Z1L5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cacna2d3Q9Z1L5 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cacna2d3Q9Z1L5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cacna2d3Q9Z1L5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cacna2d3Q9Z1L5 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cacna2d3Q9Z1L5 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cacna2d3Q9Z1L5 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cacna2d3Q9Z1L5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cacna2d3Q9Z1L5 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Cacna2d3Q9Z1L5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cacna2d3Q9Z1L5 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cacna2d3Q9Z1L5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Cacna2d3Q9Z1L5 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cacna2d3Q9Z1L5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cacna2d3Q9Z1L5 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cacna2d3Q9Z1L5 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cacna2d3Q9Z1L5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cacna2d3Q9Z1L5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cacna2d3Q9Z1L5 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cacna2d3Q9Z1L5 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Cacna2d3Q9Z1L5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Cacna2d3Q9Z1L5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cacna2d3Q9Z1L5 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cacna2d3Q9Z1L5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cacna2d3Q9Z1L5 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cacna2d3Q9Z1L5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cacna2d3Q9Z1L5 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cacna2d3Q9Z1L5 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms