Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1J3

Nfs1, Cysteine desulfurase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfs1Q9Z1J3 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Nfs1Q9Z1J3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Nfs1Q9Z1J3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Nfs1Q9Z1J3 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Nfs1Q9Z1J3 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Nfs1Q9Z1J3 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Nfs1Q9Z1J3 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Nfs1Q9Z1J3 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Nfs1Q9Z1J3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Nfs1Q9Z1J3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nfs1Q9Z1J3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Nfs1Q9Z1J3 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Nfs1Q9Z1J3 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Nfs1Q9Z1J3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Nfs1Q9Z1J3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Nfs1Q9Z1J3 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Nfs1Q9Z1J3 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Nfs1Q9Z1J3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Nfs1Q9Z1J3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Nfs1Q9Z1J3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Nfs1Q9Z1J3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Nfs1Q9Z1J3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nfs1Q9Z1J3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nfs1Q9Z1J3 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Nfs1Q9Z1J3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Nfs1Q9Z1J3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nfs1Q9Z1J3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nfs1Q9Z1J3 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nfs1Q9Z1J3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Nfs1Q9Z1J3 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nfs1Q9Z1J3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nfs1Q9Z1J3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Nfs1Q9Z1J3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nfs1Q9Z1J3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nfs1Q9Z1J3 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nfs1Q9Z1J3 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nfs1Q9Z1J3 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Nfs1Q9Z1J3 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nfs1Q9Z1J3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nfs1Q9Z1J3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nfs1Q9Z1J3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nfs1Q9Z1J3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nfs1Q9Z1J3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nfs1Q9Z1J3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nfs1Q9Z1J3 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nfs1Q9Z1J3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nfs1Q9Z1J3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Nfs1Q9Z1J3 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nfs1Q9Z1J3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nfs1Q9Z1J3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nfs1Q9Z1J3 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nfs1Q9Z1J3 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nfs1Q9Z1J3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Nfs1Q9Z1J3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Nfs1Q9Z1J3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Nfs1Q9Z1J3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Nfs1Q9Z1J3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Nfs1Q9Z1J3 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Nfs1Q9Z1J3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Nfs1Q9Z1J3 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nfs1Q9Z1J3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nfs1Q9Z1J3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nfs1Q9Z1J3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nfs1Q9Z1J3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nfs1Q9Z1J3 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nfs1Q9Z1J3 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nfs1Q9Z1J3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nfs1Q9Z1J3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Nfs1Q9Z1J3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nfs1Q9Z1J3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nfs1Q9Z1J3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Nfs1Q9Z1J3 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.53■■■□□ 2
Nfs1Q9Z1J3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Nfs1Q9Z1J3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Nfs1Q9Z1J3 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nfs1Q9Z1J3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nfs1Q9Z1J3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Nfs1Q9Z1J3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Nfs1Q9Z1J3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Nfs1Q9Z1J3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Nfs1Q9Z1J3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Nfs1Q9Z1J3 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nfs1Q9Z1J3 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nfs1Q9Z1J3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Nfs1Q9Z1J3 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Nfs1Q9Z1J3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Nfs1Q9Z1J3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Nfs1Q9Z1J3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Nfs1Q9Z1J3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Nfs1Q9Z1J3 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Nfs1Q9Z1J3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Nfs1Q9Z1J3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Nfs1Q9Z1J3 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Nfs1Q9Z1J3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Nfs1Q9Z1J3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Nfs1Q9Z1J3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Nfs1Q9Z1J3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Nfs1Q9Z1J3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Nfs1Q9Z1J3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nfs1Q9Z1J3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms