Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1E3

Nfkbia, NF-kappa-B inhibitor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbiaQ9Z1E3 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NfkbiaQ9Z1E3 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NfkbiaQ9Z1E3 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NfkbiaQ9Z1E3 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NfkbiaQ9Z1E3 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
NfkbiaQ9Z1E3 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
NfkbiaQ9Z1E3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NfkbiaQ9Z1E3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NfkbiaQ9Z1E3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NfkbiaQ9Z1E3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NfkbiaQ9Z1E3 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NfkbiaQ9Z1E3 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NfkbiaQ9Z1E3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NfkbiaQ9Z1E3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NfkbiaQ9Z1E3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NfkbiaQ9Z1E3 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NfkbiaQ9Z1E3 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NfkbiaQ9Z1E3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
NfkbiaQ9Z1E3 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NfkbiaQ9Z1E3 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NfkbiaQ9Z1E3 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NfkbiaQ9Z1E3 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NfkbiaQ9Z1E3 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NfkbiaQ9Z1E3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NfkbiaQ9Z1E3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NfkbiaQ9Z1E3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NfkbiaQ9Z1E3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NfkbiaQ9Z1E3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NfkbiaQ9Z1E3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NfkbiaQ9Z1E3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NfkbiaQ9Z1E3 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NfkbiaQ9Z1E3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
NfkbiaQ9Z1E3 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NfkbiaQ9Z1E3 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NfkbiaQ9Z1E3 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NfkbiaQ9Z1E3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NfkbiaQ9Z1E3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NfkbiaQ9Z1E3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NfkbiaQ9Z1E3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NfkbiaQ9Z1E3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NfkbiaQ9Z1E3 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NfkbiaQ9Z1E3 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NfkbiaQ9Z1E3 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NfkbiaQ9Z1E3 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NfkbiaQ9Z1E3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NfkbiaQ9Z1E3 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NfkbiaQ9Z1E3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NfkbiaQ9Z1E3 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NfkbiaQ9Z1E3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NfkbiaQ9Z1E3 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NfkbiaQ9Z1E3 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NfkbiaQ9Z1E3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NfkbiaQ9Z1E3 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NfkbiaQ9Z1E3 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NfkbiaQ9Z1E3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NfkbiaQ9Z1E3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NfkbiaQ9Z1E3 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NfkbiaQ9Z1E3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NfkbiaQ9Z1E3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NfkbiaQ9Z1E3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NfkbiaQ9Z1E3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NfkbiaQ9Z1E3 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NfkbiaQ9Z1E3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NfkbiaQ9Z1E3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NfkbiaQ9Z1E3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
NfkbiaQ9Z1E3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NfkbiaQ9Z1E3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NfkbiaQ9Z1E3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NfkbiaQ9Z1E3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NfkbiaQ9Z1E3 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NfkbiaQ9Z1E3 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NfkbiaQ9Z1E3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NfkbiaQ9Z1E3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NfkbiaQ9Z1E3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NfkbiaQ9Z1E3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NfkbiaQ9Z1E3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NfkbiaQ9Z1E3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NfkbiaQ9Z1E3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NfkbiaQ9Z1E3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NfkbiaQ9Z1E3 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NfkbiaQ9Z1E3 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NfkbiaQ9Z1E3 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NfkbiaQ9Z1E3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NfkbiaQ9Z1E3 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NfkbiaQ9Z1E3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NfkbiaQ9Z1E3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NfkbiaQ9Z1E3 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NfkbiaQ9Z1E3 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NfkbiaQ9Z1E3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NfkbiaQ9Z1E3 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NfkbiaQ9Z1E3 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NfkbiaQ9Z1E3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NfkbiaQ9Z1E3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NfkbiaQ9Z1E3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NfkbiaQ9Z1E3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NfkbiaQ9Z1E3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NfkbiaQ9Z1E3 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NfkbiaQ9Z1E3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NfkbiaQ9Z1E3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NfkbiaQ9Z1E3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms