Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z185

Padi1, Protein-arginine deiminase type-1, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Padi1Q9Z185 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Padi1Q9Z185 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Padi1Q9Z185 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Padi1Q9Z185 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Padi1Q9Z185 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Padi1Q9Z185 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Padi1Q9Z185 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Padi1Q9Z185 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Padi1Q9Z185 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Padi1Q9Z185 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Padi1Q9Z185 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Padi1Q9Z185 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Padi1Q9Z185 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Padi1Q9Z185 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Padi1Q9Z185 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Padi1Q9Z185 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Padi1Q9Z185 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Padi1Q9Z185 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Padi1Q9Z185 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Padi1Q9Z185 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Padi1Q9Z185 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Padi1Q9Z185 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Padi1Q9Z185 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Padi1Q9Z185 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Padi1Q9Z185 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Padi1Q9Z185 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Padi1Q9Z185 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Padi1Q9Z185 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Padi1Q9Z185 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Padi1Q9Z185 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Padi1Q9Z185 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Padi1Q9Z185 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Padi1Q9Z185 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Padi1Q9Z185 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Padi1Q9Z185 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Padi1Q9Z185 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Padi1Q9Z185 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Padi1Q9Z185 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Padi1Q9Z185 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Padi1Q9Z185 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Padi1Q9Z185 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Padi1Q9Z185 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Padi1Q9Z185 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Padi1Q9Z185 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Padi1Q9Z185 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Padi1Q9Z185 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Padi1Q9Z185 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Padi1Q9Z185 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Padi1Q9Z185 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Padi1Q9Z185 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Padi1Q9Z185 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Padi1Q9Z185 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Padi1Q9Z185 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Padi1Q9Z185 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Padi1Q9Z185 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Padi1Q9Z185 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Padi1Q9Z185 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Padi1Q9Z185 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Padi1Q9Z185 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Padi1Q9Z185 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Padi1Q9Z185 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Padi1Q9Z185 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Padi1Q9Z185 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Padi1Q9Z185 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Padi1Q9Z185 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Padi1Q9Z185 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Padi1Q9Z185 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Padi1Q9Z185 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Padi1Q9Z185 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Padi1Q9Z185 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Padi1Q9Z185 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Padi1Q9Z185 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Padi1Q9Z185 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Padi1Q9Z185 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Padi1Q9Z185 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Padi1Q9Z185 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Padi1Q9Z185 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Padi1Q9Z185 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Padi1Q9Z185 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Padi1Q9Z185 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Padi1Q9Z185 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Padi1Q9Z185 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Padi1Q9Z185 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Padi1Q9Z185 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Padi1Q9Z185 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Padi1Q9Z185 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Padi1Q9Z185 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Padi1Q9Z185 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Padi1Q9Z185 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Padi1Q9Z185 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Padi1Q9Z185 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Padi1Q9Z185 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Padi1Q9Z185 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Padi1Q9Z185 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Padi1Q9Z185 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Padi1Q9Z185 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Padi1Q9Z185 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Padi1Q9Z185 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Padi1Q9Z185 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Padi1Q9Z185 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms